219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3016 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3016  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  100 
 
 
142 aa  285  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.690575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2023  putative iron-sulphur protein  58.14 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.304006  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1655  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 
207 aa  101  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  42.96 
 
 
141 aa  95.9  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1640  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.74 
 
 
204 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0467943  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.83 
 
 
161 aa  90.1  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0421933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6043  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  48.31 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2525  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.87 
 
 
122 aa  88.2  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348556  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1755  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.34 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.558356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.09 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211391  hitchhiker  0.000149694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1998  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.83 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.328515  normal  0.533196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.28 
 
 
138 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3110  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  43.01 
 
 
166 aa  82.8  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0912121  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2192  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.43 
 
 
146 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105099  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1910  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.19 
 
 
171 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0215924  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3864  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.85 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0332721  normal  0.187556 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.58 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0429  plastoquinol--plastocyanin reductase  39.36 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000311251  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0361  Plastoquinol--plastocyanin reductase  41.05 
 
 
181 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000109538  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0242  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.31 
 
 
179 aa  73.2  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0970  twin-arginine translocation pathway signal  40 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3574  Rieske (2Fe-2S) region  38.89 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3647  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316159  normal  0.350025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.37 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622671  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1780  Plastoquinol--plastocyanin reductase  40.43 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00627342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6884  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.78 
 
 
151 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83573  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0466  Plastoquinol--plastocyanin reductase  38.71 
 
 
182 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.434271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4343  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.25 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.36363  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05090  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  41.03 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.884947  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1719  plastoquinol--plastocyanin reductase  34.04 
 
 
181 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000334249  normal  0.304108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5208  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.5 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0885  twin-arginine translocation pathway signal  35.11 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0145  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.58 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0519  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.13 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1987  Plastoquinol--plastocyanin reductase  38.3 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0298355  normal  0.2419 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1306  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0394  cytochrome b6-f complex, iron-sulfur subunit  36.96 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.582739  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  44.05 
 
 
102 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15420  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  39.33 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2207  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  43.24 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1191  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.9 
 
 
435 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.853402  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09350  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  30.47 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0192  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.68 
 
 
193 aa  60.8  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5207  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39 
 
 
171 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.92121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1197  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.78 
 
 
130 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4636  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.5 
 
 
141 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000647327 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0538  Rieske (2Fe-2S) region  33.61 
 
 
131 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.520467  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.03 
 
 
640 aa  55.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13360  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.29 
 
 
122 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.823074  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3142  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  39.68 
 
 
206 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.237905  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  31.91 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0085  twin-arginine translocation pathway signal  37.35 
 
 
159 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2187  FAD dependent oxidoreductase  38.75 
 
 
531 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0205  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.47 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5049  FAD dependent oxidoreductase  29.67 
 
 
513 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.495735  decreased coverage  0.00234042 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1869  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.31 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.624502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.82 
 
 
118 aa  52.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1847  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.28 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000145916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3508  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 
508 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.63 
 
 
113 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4538  Rieske (2Fe-2S) region  26.81 
 
 
136 aa  52  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.64 
 
 
639 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1541  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.55 
 
 
135 aa  51.6  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.98 
 
 
644 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1693  cytochrome b6-f complex iron-sulfur subunit  32.24 
 
 
177 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.75 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.603301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  39.68 
 
 
647 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4025  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.75 
 
 
130 aa  50.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0457  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.25 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3173  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.46 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12990  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  37.5 
 
 
170 aa  50.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0363688  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33 
 
 
212 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2105  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.11 
 
 
186 aa  50.1  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3527  FAD dependent oxidoreductase  38.37 
 
 
508 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2933  cytochrome b/b6 complex, iron-sulfur subunit  36.59 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3393  FAD dependent oxidoreductase  36.67 
 
 
507 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1751  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.01 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.17 
 
 
642 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  42.62 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1191  FAD dependent oxidoreductase  38.27 
 
 
513 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2645  FAD dependent oxidoreductase  35.37 
 
 
526 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.7 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3342  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.94 
 
 
370 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0051  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.67 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.782926  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1826  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.06 
 
 
300 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.94 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  34.33 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2076  FAD dependent oxidoreductase  39.74 
 
 
512 aa  47.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.635764  normal  0.246638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1727  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.27 
 
 
227 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.921898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>