More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1282 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1282  Rieske (2Fe-2S) domain protein  100 
 
 
137 aa  279  8.000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.580287  normal  0.705623 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2315  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  65.69 
 
 
141 aa  197  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.791717 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  45.78 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.77 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  47.22 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.55 
 
 
518 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
102 aa  72  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  38.37 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42200  Rieske type ferredoxin  38.27 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.42204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  42.68 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  32.17 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.77 
 
 
137 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2879  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.5 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.388175  normal  0.0551812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  40.74 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.74 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18750  phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  41.03 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485806  normal  0.200215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2913  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  43.59 
 
 
163 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100806  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.09 
 
 
526 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.15 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  39.24 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0434  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.66 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  30.49 
 
 
106 aa  63.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 
116 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  34.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  34.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  34.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  34.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  34.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  34.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  34.21 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.73 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4109  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  38.67 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0965  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.67 
 
 
100 aa  61.6  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00646524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.24 
 
 
114 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  37.04 
 
 
292 aa  61.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.1 
 
 
105 aa  61.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.74 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.94 
 
 
109 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
105 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.44 
 
 
123 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2338  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.27 
 
 
113 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3091  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.954428 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0167  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.85 
 
 
109 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000930652 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0130  Rieske (2Fe-2S) protein  35 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 
238 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2961  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.41 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  33.73 
 
 
109 aa  58.9  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  32.1 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.05 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  38.1 
 
 
109 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.43 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3778  Rieske (2Fe-2S) region  27.5 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  34.15 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4721  Rieske (2Fe-2S) region  30.49 
 
 
104 aa  57  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0485  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.39 
 
 
118 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.83 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.83 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20070  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  44.64 
 
 
109 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  26.47 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.53 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01974  benzene 1,2-dioxygenase ferredoxin protein  32.14 
 
 
109 aa  56.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0274053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000504578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  33.33 
 
 
270 aa  56.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.27 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1142  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.88 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.209918  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.49 
 
 
105 aa  55.1  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  28.75 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
129 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0955  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.47 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3350  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.25 
 
 
106 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0844  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.25 
 
 
106 aa  53.9  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.44 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1673  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.36 
 
 
110 aa  54.3  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.314946  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0311  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.12 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.021793 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.86 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1467  Rieske (2Fe-2S) domain protein  43.4 
 
 
107 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3247  Rieske (2Fe-2S) region  32.05 
 
 
114 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206921  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2265  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.33 
 
 
113 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.144198 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0994  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.244835  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  28 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3700  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.94 
 
 
322 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3775  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.57 
 
 
107 aa  52.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3687  Rieske (2Fe-2S) region  32.26 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3760  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.26 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21930  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  30.28 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.53 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1662  Rieske (2Fe-2S) protein  25.76 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.282248  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1359  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.18 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.77 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.47 
 
 
277 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2672  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.76 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1989  nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  35.62 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3081  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.27 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0978825  normal  0.175913 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  21.17 
 
 
118 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>