92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2045 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  213  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  55.88 
 
 		 104 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  37.86 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  38.83 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.75 
 
 		 120 aa  88.6  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40 
 
 		 111 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  36.89 
 
 		 116 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  33.98 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  38.61 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  38.61 
 
 		 108 aa  77.8  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  34.65 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.37 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.01 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.95 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  37.5 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.1 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  32.63 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 		 127 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  32.14 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1076  putative Rieske (2Fe-2S) family protein  34.85 
 
 		 356 aa  50.4  0.000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.329475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  31.73 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2516  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.51 
 
 		 326 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00793645  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  29.9 
 
 		 599 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.67 
 
 		 509 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  32.18 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.63 
 
 		 114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  37.14 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  37.78 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2485  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  39.68 
 
 		 447 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  34.92 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.59 
 
 		 504 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3294  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.07 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3232  Rieske (2Fe-2S) region  29.07 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  28.57 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 		 384 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1261  hypothetical protein  40.68 
 
 		 340 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803695 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.04 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1663  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.15 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1113  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.93 
 
 		 120 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.85 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5615  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.67 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.208156  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  32.58 
 
 		 465 aa  44.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 		 377 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  32.58 
 
 		 460 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  44.64 
 
 		 461 aa  43.9  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  29.63 
 
 		 323 aa  43.9  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6044  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  33.68 
 
 		 141 aa  43.5  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.26 
 
 		 134 aa  43.5  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.91 
 
 		 102 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.680425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0538  Rieske (2Fe-2S) protein  36.36 
 
 		 444 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3458  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.78 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28008  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.78 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0102  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.78 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5690  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.08 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0215436 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3880  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.78 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3092  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.78 
 
 		 354 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3092  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.51 
 
 		 447 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  28.57 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0093  putative benzoate 1,2-dioxygenase alpha subunit  37.31 
 
 		 363 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353624  normal  0.340117 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3962  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  34.78 
 
 		 354 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2832  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.93 
 
 		 412 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.000525331  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1349  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.61 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.203828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  33.33 
 
 		 103 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.32 
 
 		 96 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3308  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.12 
 
 		 513 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  33.33 
 
 		 477 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.29 
 
 		 397 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0616  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 		 347 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.88 
 
 		 285 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5946  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.18 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.930147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1322  Rieske (2Fe-2S) region  30 
 
 		 350 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0760232  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6507  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 		 350 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  32.05 
 
 		 242 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  27.45 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  34.38 
 
 		 474 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5949  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.62 
 
 		 342 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.193657 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6098  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 		 350 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  23.77 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2770  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.84 
 
 		 398 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0200185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.25 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0421  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.25 
 
 		 192 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14640  ferredoxin subunit of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.07 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.857724  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.93 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  32.81 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2338  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.44 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.700788 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4150  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 		 384 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.288761 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.11 
 
 		 107 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>