285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4859 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
122 aa  249  8.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  43.69 
 
 
111 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  49.02 
 
 
111 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  43.27 
 
 
111 aa  92  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  44.12 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.59 
 
 
111 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  42.59 
 
 
111 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  37.5 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  40.74 
 
 
116 aa  83.6  9e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  35 
 
 
117 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  37.5 
 
 
107 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.7 
 
 
116 aa  67.8  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.65 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.43 
 
 
116 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  34 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.19 
 
 
116 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
103 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33 
 
 
103 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2198  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.19 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0363167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2887  prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit  36.67 
 
 
475 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125851  hitchhiker  0.00158698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6009  Rieske (2Fe-2S) protein  34.34 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.322393  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2070  MocE Rieske (2Fe-2S)  33.33 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.143591  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2710  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.332301  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.34 
 
 
102 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2681  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
102 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  33.68 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  29.7 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
101 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  37.23 
 
 
649 aa  57.4  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  31.25 
 
 
599 aa  57  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5006  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.73 
 
 
105 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0704074  normal  0.0116577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1329  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.77 
 
 
118 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.316396  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  28.95 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  32.98 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1457  MocE Rieske (2Fe-2S)  33 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.768182 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2768  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 
518 aa  56.2  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0616  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.32 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.25 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  28 
 
 
242 aa  55.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.12 
 
 
509 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
521 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  28.28 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  26.42 
 
 
604 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.1 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.17 
 
 
114 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3778  Rieske (2Fe-2S) region  26 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  33.33 
 
 
108 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  29.7 
 
 
106 aa  53.9  0.0000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6777  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
103 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.130934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  27.68 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  28.16 
 
 
108 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  36 
 
 
585 aa  53.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  32.04 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  29.13 
 
 
114 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6029  Rieske (2Fe-2S) domain protein, MocE subfamily  30.3 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510688  normal  0.368717 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.93 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.71 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02432  3-phenylpropionate dioxygenase, predicted ferredoxin subunit  30 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1128  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2693  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.77141  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3772  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  32.32 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02396  hypothetical protein  30 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2692  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2825  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1137  3-phenylpropionate dioxygenase ferredoxin subunit  30 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  31.07 
 
 
112 aa  52  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  37.97 
 
 
114 aa  52  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  25 
 
 
289 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0977  Rieske (2Fe-2S) domain protein  38.1 
 
 
212 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1326  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.710748  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3495  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.9 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.65589  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  29.67 
 
 
291 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2087  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
118 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28 
 
 
105 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.07 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  25 
 
 
289 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.09 
 
 
133 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0985  Rieske (2Fe-2S) region  36.25 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.750027  hitchhiker  0.00017635 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.91 
 
 
504 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0589  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.04 
 
 
112 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  27.78 
 
 
98 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  28.95 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  24.35 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.84 
 
 
112 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4149  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
109 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.411915  normal  0.231451 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  37.04 
 
 
521 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.63 
 
 
526 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  23.97 
 
 
270 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  33.33 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.71 
 
 
521 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7184  Rieske (2Fe-2S) domain protein, MocE subfamily  30 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00608599  normal  0.029061 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1267  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  30.19 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.94 
 
 
506 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.42 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.1 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  27.78 
 
 
103 aa  48.9  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>