82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1672 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1672  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  34.48 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  33.62 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  30 
 
 		 599 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1433  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.81 
 
 		 604 aa  53.9  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479389  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.7 
 
 		 122 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.66 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.66 
 
 		 105 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.99 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  35.11 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  32.89 
 
 		 118 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.83 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  31.43 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.63 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3238  Rieske 2Fe-2S family protein  34.02 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00145958  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  31.73 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.58 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1335  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.85 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000656447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4522  Rieske (2Fe-2S) region  37.29 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1307  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.85 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1079  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  29.52 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0175517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.99 
 
 		 518 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2796  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.25 
 
 		 108 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.654028  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  33.33 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23360  assimilatory nitrite reductase, small subunit  38.81 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0534419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2251  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.322428  normal  0.209318 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.04 
 
 		 289 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.04 
 
 		 289 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  36.76 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.96 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  36.76 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2677  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  32.95 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.41 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.93 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3194  Rieske (2Fe-2S) region  32.99 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.5117e-17  hitchhiker  4.2038099999999998e-22 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.59 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0780  rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.73 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.12357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1780  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  30.39 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.307476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6323  Rieske (2Fe-2S) region  42.42 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.73 
 
 		 509 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4280  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.13 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1258  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.47 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0240354  hitchhiker  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2166  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.94 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.112377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2066  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.84 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2967  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  28 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.476557  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.77 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26520  predicted protein  32.77 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.248845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1701  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  30.59 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104071  normal  0.427616 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1586  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  37.66 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  29.35 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.4 
 
 		 158 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0845  Rieske 2Fe-2S family protein  35.59 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 		 103 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  31.07 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2558  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  27.47 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  32.35 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2673  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  30.39 
 
 		 649 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1559  vanillate monooxygenase  38.6 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662697  normal  0.47859 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3120  pyruvate oxidase  30.95 
 
 		 656 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.777401  normal  0.194873 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  31.94 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  26.92 
 
 		 123 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3778  Rieske (2Fe-2S) region  25.96 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  32.26 
 
 		 521 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2679  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  25.56 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  31.65 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5579  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 		 594 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1004  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.25 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.749918 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30.88 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3529  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  28.12 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.53 
 
 		 309 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3225  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.46 
 
 		 412 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0731874  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.59 
 
 		 322 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2209  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.75 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.149896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  29.36 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.85 
 
 		 112 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6029  Rieske (2Fe-2S) domain protein, MocE subfamily  36.99 
 
 		 104 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510688  normal  0.368717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  28.4 
 
 		 104 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1194  biphenyl 2,3-dioxygenase ferredoxin subunit (BphA3)  25.81 
 
 		 109 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889683  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>