136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0225 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0225  Rieske 2Fe-2S family protein  100 
 
 
108 aa  228  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0375984  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2847  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  68.22 
 
 
120 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.15292  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4027  hypothetical protein  42.06 
 
 
110 aa  100  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1314  Rieske (2Fe-2S) region  43.4 
 
 
111 aa  97.8  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0871721 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3558  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.34 
 
 
111 aa  94  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4634  Rieske (2Fe-2S) domain protein  44.34 
 
 
111 aa  94  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4301  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  39.81 
 
 
111 aa  93.6  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3818  Rieske (2Fe-2S) region  41.51 
 
 
111 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0794094  normal  0.0599225 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5677  Rieske (2Fe-2S) region  43.69 
 
 
116 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3342  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.75 
 
 
131 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.139334  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0930  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.4 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  39.81 
 
 
111 aa  83.6  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1765  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.538609  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0586  Rieske 2Fe-2S family protein  36.63 
 
 
104 aa  80.1  0.000000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  40.2 
 
 
111 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.61 
 
 
103 aa  77.8  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.294291  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6713  putative ferredoxin  41.98 
 
 
96 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491449  normal  0.188584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1596  toluene-4-monooxygenase system protein C  37.5 
 
 
117 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0213  Rieske (2Fe-2S) protein  35.37 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0162  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.59 
 
 
98 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000163908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3044  nitrite reductase (NAD(P)H) large subunit, NirD  37.31 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.109666  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  41.79 
 
 
442 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2814  hypothetical protein  28.45 
 
 
117 aa  53.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4859  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
122 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0807982  normal  0.0317192 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2741  cytochrome P450  35.44 
 
 
599 aa  52.8  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25917  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2964  hypothetical protein  27.83 
 
 
117 aa  51.6  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0922  methanesulfonate monooxygenase component; iron sulfur protein  37.5 
 
 
242 aa  50.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738029  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1103  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.21 
 
 
362 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  40.3 
 
 
668 aa  50.4  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  38.81 
 
 
443 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  27.71 
 
 
353 aa  49.3  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  30 
 
 
498 aa  49.3  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.09 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4451  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  31.07 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.468725  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1668  assimilatory nitrite reductase [NAD(P)H], small subunit  33.82 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0880692  normal  0.298986 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2815  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.94 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0576  Rieske (2Fe-2S) region  37.5 
 
 
323 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
285 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0544  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.3 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  36.76 
 
 
443 aa  47.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1130  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.88 
 
 
362 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0812255  normal  0.937672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  40.38 
 
 
499 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  40.7 
 
 
407 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.02 
 
 
289 aa  47  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3952  Rieske (2Fe-2S) protein  34.92 
 
 
340 aa  47  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.13771  normal  0.112958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  38.18 
 
 
442 aa  47  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2308  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  30.3 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619497  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4895  Vanillate monooxygenase  39.53 
 
 
336 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.802026  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.03 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3621  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.35 
 
 
377 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2768  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4115  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  41.38 
 
 
127 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.063358  normal  0.0248701 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.49 
 
 
509 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.21 
 
 
125 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1542  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 
366 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0106115  decreased coverage  0.000412121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0648  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 
361 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.149026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0659  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.1 
 
 
361 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.210033 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7180  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.29 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.602112 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4335  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.32 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.77 
 
 
1076 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.77 
 
 
1110 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.77 
 
 
1134 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0526  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.93 
 
 
321 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0627  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.1 
 
 
361 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.81 
 
 
1055 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.81 
 
 
1086 aa  43.9  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2246  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.07 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00879762  normal  0.228447 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1143  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.92 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.81 
 
 
1113 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.81 
 
 
1058 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1827  Rieske (2Fe-2S) region  27.55 
 
 
347 aa  43.5  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0867  Rieske (2Fe-2S) region  38.64 
 
 
357 aa  43.5  0.0009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.33 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.333878  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.38 
 
 
497 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.85 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41540  assimilatory nitrite reductase small subunit  27 
 
 
108 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2518  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.18 
 
 
398 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1370  vanillate monooxygenase  37.29 
 
 
363 aa  43.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.38 
 
 
497 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.4 
 
 
101 aa  42.7  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0217  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.98 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4419  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  35.9 
 
 
367 aa  42.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1393  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.72 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3274  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2318  assimilatory nitrite reductase (NAD(P)H) small subunit  28.43 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125191  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3012  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.12 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.123081 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3866  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.08 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3526  assimilatory nitrite reductase small subunit  28.36 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  30 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2679  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  27.27 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5415  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.61 
 
 
521 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.792379  normal  0.597511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  29.87 
 
 
369 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  34.29 
 
 
380 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1018  Rieske (2Fe-2S) region  26.67 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131503 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6339  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.35 
 
 
125 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.515952 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  35.62 
 
 
289 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.49 
 
 
326 aa  42  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.11 
 
 
100 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  31.94 
 
 
348 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4861  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.14 
 
 
365 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.641783  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>