More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_A2063 on replicon NC_009075
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  99.05 
 
 
1055 aa  2052    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  98.57 
 
 
1113 aa  2131    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  98.77 
 
 
1058 aa  2026    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  97.22 
 
 
1076 aa  2019    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  96.83 
 
 
1134 aa  2123    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 
1110 aa  2238    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  98.71 
 
 
1086 aa  2076    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  46.67 
 
 
375 aa  322  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  36.1 
 
 
376 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 
379 aa  253  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 
391 aa  240  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 
380 aa  238  3e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  37.7 
 
 
392 aa  237  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  36.1 
 
 
386 aa  234  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  36.94 
 
 
378 aa  233  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  32.19 
 
 
382 aa  233  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  32.56 
 
 
379 aa  231  5e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  37.07 
 
 
384 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  36.27 
 
 
384 aa  227  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  36.5 
 
 
390 aa  226  2e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  35.73 
 
 
384 aa  225  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  36.53 
 
 
400 aa  224  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  32.81 
 
 
385 aa  221  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.62 
 
 
387 aa  221  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 
387 aa  221  7.999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  37.18 
 
 
405 aa  219  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  32.17 
 
 
365 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  32.17 
 
 
365 aa  214  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  35.26 
 
 
397 aa  213  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  34.4 
 
 
384 aa  213  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  31.9 
 
 
365 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  31.82 
 
 
365 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  35.22 
 
 
376 aa  212  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  34.4 
 
 
384 aa  211  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  29.38 
 
 
387 aa  211  9e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  29.23 
 
 
382 aa  208  5e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  34.34 
 
 
408 aa  208  5e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  31.3 
 
 
365 aa  207  9e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  35.25 
 
 
399 aa  207  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  29.23 
 
 
382 aa  206  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  33.96 
 
 
365 aa  206  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
408 aa  205  3e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
377 aa  203  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  30.21 
 
 
377 aa  202  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  31.44 
 
 
376 aa  201  6e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.93 
 
 
399 aa  201  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  31.41 
 
 
380 aa  201  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  31.3 
 
 
365 aa  201  9e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  28.72 
 
 
382 aa  200  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  31.89 
 
 
365 aa  200  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  31.62 
 
 
365 aa  199  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  29.95 
 
 
377 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  33.86 
 
 
400 aa  199  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  29.73 
 
 
381 aa  198  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  31.27 
 
 
365 aa  196  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  33.42 
 
 
406 aa  196  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.98 
 
 
390 aa  195  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  33.6 
 
 
365 aa  194  6e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  30.67 
 
 
375 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  33.6 
 
 
365 aa  194  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  30.62 
 
 
389 aa  193  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  34.3 
 
 
389 aa  193  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  32.44 
 
 
368 aa  191  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  31.35 
 
 
365 aa  191  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  29.61 
 
 
382 aa  190  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.57 
 
 
390 aa  188  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.55 
 
 
390 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  31.55 
 
 
378 aa  185  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  29.37 
 
 
379 aa  179  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.68 
 
 
414 aa  171  9e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  28.84 
 
 
365 aa  169  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  28.18 
 
 
417 aa  167  9e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.71 
 
 
385 aa  98.6  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.72 
 
 
432 aa  96.3  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1495  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.27 
 
 
401 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1660  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.84 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1689  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.84 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.550846  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1716  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  36.84 
 
 
466 aa  78.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.77849  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4010  Rieske (2Fe-2S) protein  38.14 
 
 
376 aa  77.4  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0537  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  37.61 
 
 
466 aa  77  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.689442  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.64 
 
 
473 aa  76.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0546  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  37.61 
 
 
466 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1753  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408747 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1619  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.61 
 
 
374 aa  75.9  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  24.23 
 
 
420 aa  73.2  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  26.55 
 
 
421 aa  73.2  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3165  Rieske (2Fe-2S) region  24.37 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  25.97 
 
 
415 aa  73.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2002  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1672  Rieske (2Fe-2S) protein  22.03 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0251995  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  26.56 
 
 
421 aa  72  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1386  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.89 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.373829  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1841  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.57 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213142  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2062  Rieske 2Fe-2S domain protein  32.89 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.901443  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.57 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2028  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.57 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  42.11 
 
 
452 aa  71.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01760  hypothetical protein  33.57 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>