123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0338 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 
377 aa  780    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  67.55 
 
 
380 aa  558  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  66.4 
 
 
379 aa  551  1e-156  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  60.54 
 
 
408 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  56.33 
 
 
387 aa  448  1e-125  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  55.32 
 
 
382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  54.62 
 
 
382 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  54.62 
 
 
382 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  57.94 
 
 
380 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  54.74 
 
 
382 aa  421  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  47.63 
 
 
376 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.27 
 
 
387 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  45.79 
 
 
382 aa  364  1e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  42.53 
 
 
408 aa  362  5.0000000000000005e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  44.74 
 
 
379 aa  358  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  43.39 
 
 
378 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  45.99 
 
 
384 aa  350  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  42.67 
 
 
375 aa  350  3e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  42.89 
 
 
399 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  43.73 
 
 
386 aa  346  4e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  44.12 
 
 
384 aa  345  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  44.65 
 
 
397 aa  342  7e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  44.39 
 
 
384 aa  341  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  44.12 
 
 
384 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  42.01 
 
 
385 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  43.85 
 
 
400 aa  338  8e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  42.78 
 
 
384 aa  332  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  40.31 
 
 
391 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  42.67 
 
 
392 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  41.8 
 
 
390 aa  324  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  41.49 
 
 
376 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  39.95 
 
 
405 aa  319  6e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  38.68 
 
 
378 aa  315  8e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  38.19 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  37.96 
 
 
389 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  37.81 
 
 
400 aa  303  2.0000000000000002e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.21 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.92 
 
 
399 aa  299  6e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.37 
 
 
390 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.66 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  39.08 
 
 
365 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  36.51 
 
 
387 aa  255  7e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  37.8 
 
 
365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  37.53 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  37.27 
 
 
389 aa  252  8.000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  34.04 
 
 
381 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  35.22 
 
 
368 aa  249  4e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  36.94 
 
 
377 aa  249  8e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  36.04 
 
 
365 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  36.49 
 
 
365 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  35.77 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  35.77 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  36.49 
 
 
365 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  36.22 
 
 
365 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  35.23 
 
 
365 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  35.23 
 
 
365 aa  242  9e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  36.75 
 
 
379 aa  241  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  33.87 
 
 
365 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  35.88 
 
 
377 aa  240  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  36.93 
 
 
365 aa  238  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  34.5 
 
 
365 aa  238  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  34.5 
 
 
376 aa  229  5e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.83 
 
 
414 aa  229  7e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.08 
 
 
417 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
1055 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
1076 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
1086 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
1058 aa  204  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
1113 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
1110 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
1134 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  28.99 
 
 
375 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  22.69 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.5 
 
 
413 aa  58.2  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  23.06 
 
 
425 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21592  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
481 aa  52.8  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  23.17 
 
 
430 aa  52.8  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.93 
 
 
388 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  20.22 
 
 
402 aa  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.46 
 
 
388 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  21.48 
 
 
386 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3625  diaminopimelate decarboxylase  24.18 
 
 
420 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  20.57 
 
 
394 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  22.43 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  21.25 
 
 
420 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2188  diaminopimelate decarboxylase  22.78 
 
 
382 aa  47.8  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.08 
 
 
416 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  22.52 
 
 
386 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  20.64 
 
 
421 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1495  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.22 
 
 
401 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  21.91 
 
 
435 aa  46.6  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1995  diaminopimelate decarboxylase  22.41 
 
 
439 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000281435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  22.38 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3486  diaminopimelate decarboxylase  23.44 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  22.94 
 
 
420 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  23.17 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  21.12 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  23.84 
 
 
399 aa  45.8  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.88 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  22.38 
 
 
420 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>