95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2136 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  81.55 
 
 		 387 aa  660    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  80.32 
 
 		 377 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  80.05 
 
 		 377 aa  648    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 381 aa  790    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  68.98 
 
 		 376 aa  544  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  51.77 
 
 		 365 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  51.77 
 
 		 365 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  52.04 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  51.77 
 
 		 365 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  51.5 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  51.5 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  52.04 
 
 		 365 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  51.77 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  50.14 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  50.41 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  51.77 
 
 		 389 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  50.82 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  50.82 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  50.55 
 
 		 365 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  47.71 
 
 		 368 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  48.74 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.24 
 
 		 414 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  50 
 
 		 379 aa  353  4e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  47.68 
 
 		 365 aa  349  6e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  39.74 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  38.5 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  37.17 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  40.63 
 
 		 376 aa  268  8e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  36.93 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  37.73 
 
 		 387 aa  266  5e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  38.54 
 
 		 384 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  38.54 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  38.54 
 
 		 397 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  38.67 
 
 		 376 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  36.91 
 
 		 390 aa  259  8e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  36.44 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  36.27 
 
 		 382 aa  257  2e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  36.27 
 
 		 382 aa  256  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  39.84 
 
 		 380 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  35.86 
 
 		 408 aa  253  6e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  36.66 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  37.2 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  34.04 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  36.02 
 
 		 375 aa  247  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  36.75 
 
 		 399 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  36.02 
 
 		 382 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  35.85 
 
 		 400 aa  246  4e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  36.1 
 
 		 379 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  34.73 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  36.41 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  35.85 
 
 		 384 aa  243  6e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  33.67 
 
 		 405 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  34.02 
 
 		 391 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.43 
 
 		 387 aa  240  4e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.39 
 
 		 390 aa  232  7.000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  33.25 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  35.58 
 
 		 386 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  35.28 
 
 		 378 aa  224  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 408 aa  222  8e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  34.21 
 
 		 385 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  32.75 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.78 
 
 		 390 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.63 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.19 
 
 		 399 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.84 
 
 		 1086 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.84 
 
 		 1058 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.84 
 
 		 1076 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.84 
 
 		 1055 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.84 
 
 		 1134 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.73 
 
 		 1110 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.84 
 
 		 1113 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  30.75 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  21.45 
 
 		 417 aa  50.4  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  20.05 
 
 		 435 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  21.47 
 
 		 447 aa  50.1  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  22.65 
 
 		 416 aa  49.7  0.00009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  20.84 
 
 		 410 aa  46.6  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  26.79 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  27.27 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  24.28 
 
 		 414 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  27.27 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  18.91 
 
 		 394 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  23.13 
 
 		 412 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  19.69 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  21.92 
 
 		 457 aa  43.9  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  24.1 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  26.19 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  22.31 
 
 		 393 aa  43.1  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  26.19 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  26.19 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  26.19 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  24.9 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  22.55 
 
 		 427 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>