164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1198 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 390 aa  800    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  68.92 
 
 		 399 aa  577  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  63.59 
 
 		 390 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  56.58 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  51.05 
 
 		 384 aa  401  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  52.11 
 
 		 384 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  50.53 
 
 		 397 aa  395  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  51.32 
 
 		 384 aa  397  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  51.3 
 
 		 392 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  50.53 
 
 		 400 aa  393  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  50.79 
 
 		 384 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  49.73 
 
 		 384 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  46.86 
 
 		 389 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  48.42 
 
 		 378 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  43.31 
 
 		 379 aa  350  3e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  45.83 
 
 		 390 aa  347  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  46.23 
 
 		 405 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  44.06 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  43.8 
 
 		 376 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  45.78 
 
 		 391 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  45.48 
 
 		 399 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  43.88 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  43.61 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  41.21 
 
 		 380 aa  315  7e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  44.71 
 
 		 376 aa  312  5.999999999999999e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  39.21 
 
 		 382 aa  310  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  40.26 
 
 		 379 aa  306  3e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  42.02 
 
 		 386 aa  302  7.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  43.62 
 
 		 375 aa  301  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  37.37 
 
 		 377 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  41.38 
 
 		 380 aa  288  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  39.32 
 
 		 385 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  36.95 
 
 		 382 aa  277  3e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  37.21 
 
 		 382 aa  276  3e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  36.79 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  39.15 
 
 		 400 aa  272  8.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  37.14 
 
 		 408 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  36.91 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.33 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  34.92 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  33.96 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  34.67 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  34.64 
 
 		 379 aa  227  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  35.2 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  35.64 
 
 		 365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  34.93 
 
 		 365 aa  225  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  34.4 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  34.13 
 
 		 365 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  34.22 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  34.13 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  34.13 
 
 		 365 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  34.13 
 
 		 365 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  34.32 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  32.53 
 
 		 365 aa  215  9e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  33.69 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  34.47 
 
 		 376 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  35.92 
 
 		 365 aa  212  9e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  32.63 
 
 		 381 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  35.66 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  34.85 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  33.51 
 
 		 377 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.85 
 
 		 417 aa  205  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.36 
 
 		 414 aa  203  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  33.6 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.12 
 
 		 1055 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.38 
 
 		 1058 aa  189  8e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.38 
 
 		 1086 aa  189  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.12 
 
 		 1076 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.12 
 
 		 1113 aa  189  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.31 
 
 		 1110 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.12 
 
 		 1134 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  26.2 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  26.29 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  24.74 
 
 		 421 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  26.79 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0894  ornithine decarboxylase  27.71 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.199626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0864  ornithine decarboxylase  27.71 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0908  ornithine decarboxylase  27.71 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  25.3 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2002  diaminopimelate decarboxylase  23.02 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  23.55 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4247  ornithine decarboxylase  28.49 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0801  ornithine decarboxylase  27.71 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  25.91 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4314  ornithine decarboxylase  25.77 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0146694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4572  pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain protein  28.49 
 
 		 359 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12320  Ornithine decarboxylase  25.52 
 
 		 387 aa  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0077  ornithine decarboxylase  25.15 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  23.88 
 
 		 421 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  27.38 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  23.76 
 
 		 466 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  25.09 
 
 		 421 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  23.61 
 
 		 412 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  23.79 
 
 		 393 aa  50.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  24.41 
 
 		 421 aa  50.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  26.61 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  23.75 
 
 		 419 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  23.24 
 
 		 412 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  23.62 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>