155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6505 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 399 aa  816    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  63.19 
 
 		 378 aa  486  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  59.27 
 
 		 382 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  59.53 
 
 		 376 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  57.77 
 
 		 389 aa  451  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  58.19 
 
 		 405 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  58.1 
 
 		 384 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  56.81 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  56.85 
 
 		 397 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  57.07 
 
 		 384 aa  444  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.47 
 
 		 387 aa  438  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  55.27 
 
 		 384 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  54.57 
 
 		 392 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  55.82 
 
 		 384 aa  428  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  50.79 
 
 		 382 aa  422  1e-117  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  55.03 
 
 		 384 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  56.1 
 
 		 390 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  51.96 
 
 		 379 aa  424  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  53.89 
 
 		 391 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  53.62 
 
 		 408 aa  414  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  48.08 
 
 		 380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  52.59 
 
 		 380 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  50.25 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  47.45 
 
 		 379 aa  387  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  50.87 
 
 		 406 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  49.61 
 
 		 386 aa  373  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  47.76 
 
 		 375 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.36 
 
 		 399 aa  361  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  48.81 
 
 		 376 aa  357  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  43.03 
 
 		 408 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  44.5 
 
 		 382 aa  350  3e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  48.89 
 
 		 400 aa  348  1e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  42.89 
 
 		 377 aa  347  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  44.25 
 
 		 382 aa  346  3e-94  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  44.25 
 
 		 382 aa  346  5e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.48 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  46.48 
 
 		 378 aa  340  4e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.93 
 
 		 390 aa  340  4e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.39 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  42.89 
 
 		 387 aa  332  6e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  42.52 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  42.78 
 
 		 365 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  42.52 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  42.52 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  41.99 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  44.88 
 
 		 365 aa  293  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  41.47 
 
 		 365 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  42.78 
 
 		 365 aa  288  2e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  42.78 
 
 		 365 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  43.04 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  44.09 
 
 		 368 aa  282  8.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  41.73 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.6 
 
 		 414 aa  272  8.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  39.16 
 
 		 417 aa  272  9e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  39.85 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  42.78 
 
 		 365 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  43.31 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  43.04 
 
 		 365 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  37.88 
 
 		 387 aa  258  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  39.11 
 
 		 365 aa  253  5.000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  36.75 
 
 		 381 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  37.82 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  37.56 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  36.65 
 
 		 376 aa  239  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.25 
 
 		 1055 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.25 
 
 		 1113 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.25 
 
 		 1086 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.25 
 
 		 1110 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.25 
 
 		 1058 aa  207  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.25 
 
 		 1076 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.25 
 
 		 1134 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  33.51 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  24.52 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  22.52 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  26.83 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  26.42 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2740  diaminopimelate decarboxylase  24.28 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2691  diaminopimelate decarboxylase  24.56 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  24.94 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  25.37 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  24.94 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  25.82 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  21.11 
 
 		 424 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  24.26 
 
 		 417 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  24.69 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  22.56 
 
 		 440 aa  53.5  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  26.79 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  21.79 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  22.31 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  20.9 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  21.34 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  27.27 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  25.1 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2188  diaminopimelate decarboxylase  24.49 
 
 		 382 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  23.67 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  28.95 
 
 		 445 aa  50.4  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  21.23 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1495  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  28.12 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  24.68 
 
 		 431 aa  50.4  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3606  diaminopimelate decarboxylase  22.98 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00198954  hitchhiker  0.0000000450016 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>