More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1225 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 413 aa  839    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  54.15 
 
 		 416 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000066198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0628  diaminopimelate decarboxylase  54.61 
 
 		 420 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1641  diaminopimelate decarboxylase  53.4 
 
 		 420 aa  454  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0302  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  53.06 
 
 		 419 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1405  diaminopimelate decarboxylase  52.93 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3249  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  51.12 
 
 		 421 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0299  diaminopimelate decarboxylase  52.81 
 
 		 417 aa  424  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000126182  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00760  diaminopimelate decarboxylase  47.39 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1355  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.01 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.146910000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28180  diaminopimelate decarboxylase  46.45 
 
 		 432 aa  391  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2859  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.26 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000208534  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0514  Diaminopimelate decarboxylase  47.34 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534186 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2135  diaminopimelate decarboxylase  48.01 
 
 		 418 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329469  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  36.84 
 
 		 402 aa  232  7.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  34.85 
 
 		 425 aa  220  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  33 
 
 		 430 aa  207  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  35.44 
 
 		 386 aa  206  7e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  32.04 
 
 		 409 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  35.19 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  31.67 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  30.69 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  32.33 
 
 		 398 aa  196  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  34 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  31.99 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  30.98 
 
 		 421 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  32.15 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  32.12 
 
 		 421 aa  193  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  31.36 
 
 		 416 aa  192  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  30.48 
 
 		 430 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  32.6 
 
 		 416 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 399 aa  190  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  29.83 
 
 		 410 aa  187  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  33.58 
 
 		 401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  31.41 
 
 		 430 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  36.82 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  33.01 
 
 		 419 aa  182  9.000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  29.6 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  29.68 
 
 		 466 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  33.09 
 
 		 393 aa  177  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  30.11 
 
 		 878 aa  176  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.66 
 
 		 859 aa  175  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  31.44 
 
 		 859 aa  173  5.999999999999999e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  32.01 
 
 		 420 aa  173  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  34.39 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 401 aa  170  5e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  30.67 
 
 		 402 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  32.43 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  32.12 
 
 		 440 aa  167  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  29.34 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0733  diaminopimelate decarboxylase  30.07 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  29.75 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  29.71 
 
 		 434 aa  165  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0612  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.239326  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  31.02 
 
 		 403 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  28.4 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 		 418 aa  163  6e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  32.1 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3486  diaminopimelate decarboxylase  29.78 
 
 		 420 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  30.15 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3625  diaminopimelate decarboxylase  30.02 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  31.03 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5726  diaminopimelate decarboxylase  31.02 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  29.19 
 
 		 412 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  28.64 
 
 		 410 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  27.53 
 
 		 444 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  29.8 
 
 		 434 aa  159  9e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1645  diaminopimelate decarboxylase  29.88 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 420 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  30.25 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  30.25 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  27.98 
 
 		 410 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  30.25 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  30.25 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  30.25 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  30.25 
 
 		 420 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  28.68 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  29.98 
 
 		 434 aa  157  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  27.98 
 
 		 410 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  28.47 
 
 		 425 aa  157  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  30.12 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  29.48 
 
 		 447 aa  156  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  29.14 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  29.88 
 
 		 415 aa  156  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7089  diaminopimelate decarboxylase  27.68 
 
 		 413 aa  156  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  29.78 
 
 		 415 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2466  diaminopimelate decarboxylase  28.16 
 
 		 463 aa  155  9e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.093066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0753  diaminopimelate decarboxylase  28.64 
 
 		 420 aa  155  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  30.9 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  29.78 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  30.12 
 
 		 443 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  30.43 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>