More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1656 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  100 
 
 		 878 aa  1764    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  49.59 
 
 		 859 aa  874    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  49.82 
 
 		 859 aa  877    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  48.74 
 
 		 868 aa  758    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  48.54 
 
 		 850 aa  751    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  48.86 
 
 		 864 aa  762    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  48.51 
 
 		 868 aa  759    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  51.4 
 
 		 857 aa  834    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  33.61 
 
 		 471 aa  245  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  34.11 
 
 		 471 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  35.98 
 
 		 469 aa  238  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  35.83 
 
 		 471 aa  234  6e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  35.47 
 
 		 416 aa  234  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  39.19 
 
 		 421 aa  233  9e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  33.61 
 
 		 471 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  38.17 
 
 		 421 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  33.4 
 
 		 471 aa  226  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  31.96 
 
 		 456 aa  223  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  33.12 
 
 		 449 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  33.91 
 
 		 455 aa  220  8.999999999999998e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  35.88 
 
 		 425 aa  220  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  34.86 
 
 		 471 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  32.55 
 
 		 471 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  33.26 
 
 		 455 aa  218  4e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  35.58 
 
 		 434 aa  218  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  30.9 
 
 		 541 aa  218  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  33.91 
 
 		 454 aa  217  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  36.94 
 
 		 402 aa  217  9e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  33.26 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  33.91 
 
 		 458 aa  216  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  35.83 
 
 		 409 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  34.92 
 
 		 449 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  34.92 
 
 		 449 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  34.92 
 
 		 449 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  34.92 
 
 		 449 aa  215  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  34.92 
 
 		 449 aa  214  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  32.32 
 
 		 461 aa  211  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  32.32 
 
 		 461 aa  211  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  32.32 
 
 		 461 aa  210  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  33.04 
 
 		 446 aa  209  1e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  33.98 
 
 		 449 aa  207  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  33.98 
 
 		 449 aa  207  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  33.98 
 
 		 449 aa  207  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3668  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.07 
 
 		 819 aa  207  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  33.98 
 
 		 449 aa  207  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 		 453 aa  207  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3863  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.07 
 
 		 819 aa  207  8e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  34.33 
 
 		 451 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  34.33 
 
 		 451 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  33.98 
 
 		 449 aa  206  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  34.33 
 
 		 451 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  34.4 
 
 		 451 aa  206  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  34.4 
 
 		 451 aa  206  2e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  34.18 
 
 		 452 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  33.77 
 
 		 449 aa  206  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  34.26 
 
 		 451 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  33.77 
 
 		 449 aa  204  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  33.9 
 
 		 451 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  33.77 
 
 		 449 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  35.13 
 
 		 450 aa  204  5e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  34.19 
 
 		 451 aa  204  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  34.27 
 
 		 456 aa  204  8e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  34.64 
 
 		 449 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  33.55 
 
 		 449 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  34.71 
 
 		 451 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  31.58 
 
 		 437 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0533  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.71 
 
 		 818 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3476  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.56 
 
 		 819 aa  201  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0572  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.27 
 
 		 818 aa  201  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0808  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.56 
 
 		 819 aa  201  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3604  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.56 
 
 		 819 aa  201  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.331342  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  31.93 
 
 		 823 aa  201  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  32.29 
 
 		 406 aa  201  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  31.4 
 
 		 463 aa  201  6e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0683  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32 
 
 		 819 aa  201  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000368651  normal  0.0727527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  31.58 
 
 		 818 aa  200  7.999999999999999e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  30.87 
 
 		 450 aa  200  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  31.13 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.5 
 
 		 820 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.5 
 
 		 820 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.5 
 
 		 820 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.5 
 
 		 820 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.5 
 
 		 820 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  31.63 
 
 		 440 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.95 
 
 		 820 aa  199  2.0000000000000003e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  31.8 
 
 		 449 aa  198  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  32.17 
 
 		 450 aa  198  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  34.34 
 
 		 459 aa  197  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  33.54 
 
 		 820 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  33.54 
 
 		 820 aa  196  1e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0564  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.77 
 
 		 820 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.54 
 
 		 820 aa  196  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.54 
 
 		 820 aa  196  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  33.54 
 
 		 820 aa  196  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.54 
 
 		 820 aa  196  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  34.12 
 
 		 420 aa  196  2e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.54 
 
 		 820 aa  196  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  30.27 
 
 		 468 aa  196  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.33 
 
 		 820 aa  195  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  34.76 
 
 		 407 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>