More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1651 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  98.51 
 
 		 402 aa  807    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  98.26 
 
 		 402 aa  803    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 402 aa  821    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  72.82 
 
 		 401 aa  587  1e-167  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  66.75 
 
 		 399 aa  546  1e-154  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  64.43 
 
 		 407 aa  525  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  63.68 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  62.72 
 
 		 403 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  61.4 
 
 		 401 aa  498  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  58.85 
 
 		 403 aa  483  1e-135  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  46.89 
 
 		 415 aa  353  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  44.9 
 
 		 420 aa  349  4e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  42.75 
 
 		 412 aa  349  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  44.78 
 
 		 427 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  44.42 
 
 		 434 aa  347  3e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  44.53 
 
 		 427 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  44.27 
 
 		 427 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  46.75 
 
 		 414 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  44.73 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  42.64 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  45.75 
 
 		 427 aa  342  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  44.53 
 
 		 416 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  45.11 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  46.49 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  42.39 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  44.84 
 
 		 417 aa  339  4e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  43.32 
 
 		 422 aa  339  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  45.11 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  46.15 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  45.43 
 
 		 414 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  43.54 
 
 		 417 aa  335  5.999999999999999e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  44.84 
 
 		 423 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  43.86 
 
 		 419 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  46.11 
 
 		 414 aa  335  7e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  43.86 
 
 		 419 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  46.11 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  46.11 
 
 		 414 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  44.53 
 
 		 417 aa  335  9e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  45.15 
 
 		 415 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  42.39 
 
 		 418 aa  334  2e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  44.67 
 
 		 415 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  46.1 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  44.42 
 
 		 415 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  45.73 
 
 		 445 aa  332  5e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  44.53 
 
 		 423 aa  332  6e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  46.38 
 
 		 414 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  45.34 
 
 		 414 aa  331  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  44.27 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  44.64 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  43 
 
 		 434 aa  330  2e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  43.43 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  43.64 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  43.43 
 
 		 417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  43.86 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  44.7 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  44.28 
 
 		 422 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  44.33 
 
 		 421 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  46.15 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  45.83 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  43.78 
 
 		 422 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  43.78 
 
 		 421 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  44.84 
 
 		 421 aa  325  6e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  43.07 
 
 		 421 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  43.69 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  43.18 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  41.49 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  43.37 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  43.18 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  43.86 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  42.57 
 
 		 420 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  42.89 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  41.41 
 
 		 415 aa  323  4e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  44.39 
 
 		 414 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  43.36 
 
 		 418 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  45.32 
 
 		 421 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  44.53 
 
 		 415 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  45.34 
 
 		 414 aa  320  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  44.78 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  40.75 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  43.37 
 
 		 415 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  41.56 
 
 		 421 aa  319  7e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  44.73 
 
 		 420 aa  318  7.999999999999999e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  42.42 
 
 		 445 aa  318  9e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  41.81 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  43.38 
 
 		 415 aa  318  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  43.11 
 
 		 415 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  45.2 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  42.61 
 
 		 427 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  43.69 
 
 		 418 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  44.39 
 
 		 443 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  42.75 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  45.2 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  43.96 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  40.62 
 
 		 416 aa  316  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  43.11 
 
 		 415 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  41.94 
 
 		 418 aa  316  5e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  41.77 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  42.09 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  42.09 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  42.09 
 
 		 423 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>