More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0834 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 418 aa  849    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  49.75 
 
 		 415 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  50 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  49.27 
 
 		 416 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  47.45 
 
 		 418 aa  411  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  48.04 
 
 		 423 aa  411  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  46.81 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  47.79 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  46.81 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  48.67 
 
 		 425 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  45.1 
 
 		 416 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  46.08 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  47.07 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  46.57 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  46.59 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  47.28 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  46.1 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  47.01 
 
 		 420 aa  381  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  46.08 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  45.61 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  46.08 
 
 		 419 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 		 417 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  46.21 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  43.63 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  44.61 
 
 		 414 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  43.63 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  43.63 
 
 		 414 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  44.39 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  45.72 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2916  diaminopimelate decarboxylase  46.23 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0948953  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  45.74 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  43.38 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  44.34 
 
 		 419 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  47.09 
 
 		 430 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  44.12 
 
 		 414 aa  362  6e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  45.68 
 
 		 418 aa  361  1e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  44.88 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  42.89 
 
 		 414 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  44.15 
 
 		 419 aa  359  4e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  46.6 
 
 		 403 aa  359  6e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  45.61 
 
 		 417 aa  358  7e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  45.32 
 
 		 432 aa  357  9.999999999999999e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  43.14 
 
 		 414 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  44.39 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  46.21 
 
 		 443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  46.35 
 
 		 403 aa  356  3.9999999999999996e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  43.24 
 
 		 418 aa  356  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  45.32 
 
 		 415 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  44.94 
 
 		 417 aa  355  8.999999999999999e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  43.93 
 
 		 427 aa  355  8.999999999999999e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  44.94 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  45.28 
 
 		 422 aa  354  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  44.69 
 
 		 451 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  42.4 
 
 		 414 aa  353  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  44.34 
 
 		 422 aa  353  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  45.28 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  42.65 
 
 		 414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  43.07 
 
 		 417 aa  353  4e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  43.41 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  44.44 
 
 		 431 aa  351  1e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  43.63 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0992  diaminopimelate decarboxylase  44.66 
 
 		 427 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  42.54 
 
 		 434 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  43.07 
 
 		 416 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  44.44 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  45.12 
 
 		 443 aa  350  3e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  42.89 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  42.4 
 
 		 414 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  44.2 
 
 		 423 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  43.99 
 
 		 417 aa  350  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  46.02 
 
 		 414 aa  349  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  42.68 
 
 		 415 aa  349  5e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  44.39 
 
 		 421 aa  348  7e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0669  diaminopimelate decarboxylase  43.99 
 
 		 428 aa  348  9e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  46.06 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  42.4 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  43.66 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  40.38 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  43.41 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  42.4 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  44.83 
 
 		 415 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  45.19 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  44.58 
 
 		 415 aa  345  6e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  42.16 
 
 		 414 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  43.87 
 
 		 414 aa  345  6e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  42.65 
 
 		 414 aa  344  1e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  43.98 
 
 		 445 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  43.99 
 
 		 416 aa  344  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  44.42 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  43.13 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  43.38 
 
 		 415 aa  343  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  43.99 
 
 		 416 aa  342  5e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  43.03 
 
 		 427 aa  342  5.999999999999999e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  43.52 
 
 		 421 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  43.52 
 
 		 421 aa  342  8e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  43.03 
 
 		 420 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  42.96 
 
 		 421 aa  340  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  42.89 
 
 		 415 aa  339  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3116  diaminopimelate decarboxylase  44.15 
 
 		 424 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>