More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4876 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 416 aa  856    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000066198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1641  diaminopimelate decarboxylase  68.75 
 
 		 420 aa  619  1e-176  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0628  diaminopimelate decarboxylase  67.55 
 
 		 420 aa  599  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00760  diaminopimelate decarboxylase  57.45 
 
 		 445 aa  512  1e-144  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3249  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  57.91 
 
 		 421 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0302  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.55 
 
 		 419 aa  491  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28180  diaminopimelate decarboxylase  54.48 
 
 		 432 aa  482  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000200142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.15 
 
 		 413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2859  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  57.07 
 
 		 421 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000208534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1405  diaminopimelate decarboxylase  54.39 
 
 		 419 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1355  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.58 
 
 		 421 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.146910000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0299  diaminopimelate decarboxylase  53.43 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000126182  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2135  diaminopimelate decarboxylase  56.44 
 
 		 418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000329469  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0514  Diaminopimelate decarboxylase  51.66 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00534186 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  34.63 
 
 		 402 aa  229  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  32.76 
 
 		 425 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  33.49 
 
 		 430 aa  206  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  32.66 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  32.92 
 
 		 429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  32.17 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 386 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  31.16 
 
 		 409 aa  196  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  31.08 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  32.34 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  33.92 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  30.71 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  31.4 
 
 		 416 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 		 420 aa  186  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  30.4 
 
 		 424 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  30.62 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  32.25 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  34.73 
 
 		 399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 401 aa  182  7e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  34.49 
 
 		 440 aa  181  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  30.22 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  30.45 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  30.33 
 
 		 406 aa  179  9e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  32.66 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  31.94 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  32.77 
 
 		 435 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  31.28 
 
 		 425 aa  176  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  32.92 
 
 		 412 aa  176  8e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  30.96 
 
 		 416 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  30.19 
 
 		 421 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  31.76 
 
 		 423 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 436 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  33 
 
 		 412 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  32.53 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  31.66 
 
 		 441 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 		 436 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 407 aa  172  6.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  32.09 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  30.36 
 
 		 410 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  31.14 
 
 		 416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  31.78 
 
 		 403 aa  167  4e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  32.1 
 
 		 402 aa  166  5e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  27.83 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  33 
 
 		 448 aa  166  8e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  30.53 
 
 		 410 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  32.1 
 
 		 402 aa  166  9e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  31.02 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  31.74 
 
 		 412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  32.1 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  31.45 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  30.79 
 
 		 434 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  30.22 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  29.95 
 
 		 435 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3166  diaminopimelate decarboxylase  29.98 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.603838 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 434 aa  163  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  31.42 
 
 		 434 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  28.4 
 
 		 417 aa  162  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  30.2 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  30.42 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0733  diaminopimelate decarboxylase  31.75 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  27.9 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  30.88 
 
 		 420 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  32.1 
 
 		 403 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  31.45 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5726  diaminopimelate decarboxylase  31.11 
 
 		 416 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3940  diaminopimelate decarboxylase  28.01 
 
 		 461 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  30.6 
 
 		 427 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  29.12 
 
 		 420 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  30.77 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  30.52 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  28.88 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  28.11 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  28.47 
 
 		 416 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  28.88 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 420 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1053  diaminopimelate decarboxylase  28.94 
 
 		 458 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.861814  normal  0.885214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>