More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0791 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 466 aa  927    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  60.4 
 
 		 453 aa  502  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3166  diaminopimelate decarboxylase  55.02 
 
 		 413 aa  456  1e-127  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.603838 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2740  diaminopimelate decarboxylase  53.62 
 
 		 411 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2691  diaminopimelate decarboxylase  53.21 
 
 		 419 aa  451  1e-125  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  35.88 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  37.79 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  35.19 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  36.83 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  35.98 
 
 		 401 aa  221  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  36.34 
 
 		 410 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  33.09 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  33.65 
 
 		 418 aa  220  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  37.87 
 
 		 868 aa  219  7e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  35.28 
 
 		 410 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  35.73 
 
 		 422 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  34.51 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  37.56 
 
 		 864 aa  218  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  35.46 
 
 		 434 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  37.38 
 
 		 868 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  36.01 
 
 		 430 aa  216  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  34.48 
 
 		 433 aa  216  9e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  34.67 
 
 		 412 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  35.55 
 
 		 425 aa  213  9e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  32.38 
 
 		 402 aa  212  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  34.85 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5726  diaminopimelate decarboxylase  33.95 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  33.8 
 
 		 403 aa  210  5e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  36.97 
 
 		 850 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  33.81 
 
 		 412 aa  209  9e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  33.73 
 
 		 416 aa  209  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  33.79 
 
 		 412 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  36.96 
 
 		 385 aa  209  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  34.09 
 
 		 430 aa  209  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  34.32 
 
 		 412 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  35.89 
 
 		 416 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  32.86 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  32.86 
 
 		 402 aa  207  4e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  34.99 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  31 
 
 		 398 aa  206  7e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  33.03 
 
 		 417 aa  205  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  33.98 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  33.79 
 
 		 403 aa  205  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  33.98 
 
 		 422 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3483  diaminopimelate decarboxylase  33.56 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4883  diaminopimelate decarboxylase  33.56 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  31.86 
 
 		 417 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  33.49 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  31.65 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  35.21 
 
 		 421 aa  203  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  33.26 
 
 		 412 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  31.69 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4771  diaminopimelate decarboxylase  33.41 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  31.25 
 
 		 406 aa  202  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  35.32 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  31.91 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  34.4 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  35.46 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  34.63 
 
 		 427 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  34.65 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  33.88 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  32.94 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  34.52 
 
 		 445 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5403  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 412 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  35.17 
 
 		 423 aa  200  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  33.73 
 
 		 421 aa  200  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  34.8 
 
 		 421 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  35.56 
 
 		 440 aa  199  7e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  34.19 
 
 		 415 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  32.79 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  32.79 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  34.58 
 
 		 416 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  34.88 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  34.88 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  34.25 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  31.25 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  34.04 
 
 		 421 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  31.66 
 
 		 410 aa  196  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  33.03 
 
 		 420 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  34.7 
 
 		 419 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  32.54 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  34.19 
 
 		 415 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  30.09 
 
 		 382 aa  196  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  35.87 
 
 		 421 aa  196  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  35.95 
 
 		 418 aa  196  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  34.47 
 
 		 421 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  32.56 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  33.97 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  34.19 
 
 		 415 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  35.46 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 420 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 420 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>