More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0634 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 433 aa  893    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  62.73 
 
 		 430 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  64.97 
 
 		 430 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  62.09 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  61.57 
 
 		 430 aa  535  1e-151  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  48.58 
 
 		 440 aa  387  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  42.79 
 
 		 420 aa  313  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  41.65 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  39.42 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  39.66 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  40.05 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  39.81 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  40.9 
 
 		 451 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  39.95 
 
 		 416 aa  295  8e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  38.77 
 
 		 445 aa  291  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  36.34 
 
 		 435 aa  289  8e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  40.28 
 
 		 425 aa  288  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  39.05 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  37.62 
 
 		 423 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  37.47 
 
 		 419 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  36.95 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 		 443 aa  286  5.999999999999999e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  38.54 
 
 		 415 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  38.85 
 
 		 418 aa  285  8e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  40.24 
 
 		 415 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  40.24 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  40.24 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  36.95 
 
 		 436 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  38.5 
 
 		 418 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  39.86 
 
 		 415 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  39.38 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  36.28 
 
 		 434 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  38.55 
 
 		 445 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  37.94 
 
 		 443 aa  280  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  40.2 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  36.64 
 
 		 436 aa  279  7e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  40.64 
 
 		 423 aa  279  7e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  38.39 
 
 		 415 aa  279  7e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  36.03 
 
 		 436 aa  278  1e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  36.97 
 
 		 417 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  37.29 
 
 		 418 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  39.57 
 
 		 415 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  36.75 
 
 		 416 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  39.9 
 
 		 414 aa  276  6e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  36.52 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  39.52 
 
 		 415 aa  276  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  37.68 
 
 		 415 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  37.67 
 
 		 424 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  37.65 
 
 		 425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  39.55 
 
 		 414 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  38.97 
 
 		 421 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  39.62 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  41.23 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 417 aa  273  6e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  36.93 
 
 		 421 aa  273  6e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  38.41 
 
 		 430 aa  272  7e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  38.95 
 
 		 420 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  37.99 
 
 		 420 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  36.28 
 
 		 438 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  39.24 
 
 		 421 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  36.01 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  38.41 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  38.33 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  34.73 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  38.88 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  38.88 
 
 		 419 aa  270  4e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  36.19 
 
 		 420 aa  269  5.9999999999999995e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  34.64 
 
 		 402 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  39.04 
 
 		 437 aa  269  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  34.73 
 
 		 402 aa  269  8e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  38.12 
 
 		 422 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  39.47 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  39.19 
 
 		 420 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  36.64 
 
 		 417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  39.38 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  39.47 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  39.47 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  37.83 
 
 		 421 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  39.47 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  39.47 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  39.47 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 423 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  39.18 
 
 		 422 aa  266  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  37.09 
 
 		 421 aa  266  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  38.97 
 
 		 432 aa  266  7e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  37.41 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  37.07 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  37.07 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  37.07 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  37.35 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4848  diaminopimelate decarboxylase  37.91 
 
 		 423 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0050  diaminopimelate decarboxylase  38.17 
 
 		 423 aa  264  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  39.15 
 
 		 423 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  38.13 
 
 		 421 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  37.96 
 
 		 417 aa  263  4.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0562  diaminopimelate decarboxylase  33.64 
 
 		 431 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  38.52 
 
 		 416 aa  263  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  38.2 
 
 		 421 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  36.61 
 
 		 417 aa  263  6e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>