More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1011 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  48.86 
 
 		 878 aa  769    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  42.1 
 
 		 859 aa  677    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  41.75 
 
 		 859 aa  674    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.1 
 
 		 857 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  74.28 
 
 		 868 aa  1299    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  74.05 
 
 		 868 aa  1297    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  100 
 
 		 864 aa  1754    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  81.8 
 
 		 850 aa  1422    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  37.56 
 
 		 466 aa  226  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  31.3 
 
 		 454 aa  209  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  31.71 
 
 		 469 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  33.24 
 
 		 416 aa  207  7e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  30.7 
 
 		 458 aa  206  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  31.14 
 
 		 458 aa  205  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  30.87 
 
 		 455 aa  204  5e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  36.36 
 
 		 421 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  35.62 
 
 		 412 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 453 aa  202  3e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  31.99 
 
 		 471 aa  201  5e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  31.55 
 
 		 455 aa  201  7e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  35 
 
 		 412 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  34.06 
 
 		 449 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  30.06 
 
 		 471 aa  197  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  31.06 
 
 		 471 aa  197  8.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  35.54 
 
 		 386 aa  197  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  35.54 
 
 		 386 aa  195  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3483  diaminopimelate decarboxylase  35 
 
 		 412 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4883  diaminopimelate decarboxylase  35 
 
 		 412 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5403  diaminopimelate decarboxylase  35 
 
 		 412 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  36.27 
 
 		 421 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  34.75 
 
 		 425 aa  194  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 402 aa  194  6e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  31.32 
 
 		 451 aa  194  7e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  30.5 
 
 		 450 aa  193  9e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  30.04 
 
 		 461 aa  193  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  34.83 
 
 		 412 aa  192  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  30.67 
 
 		 450 aa  193  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  29.82 
 
 		 461 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  34.92 
 
 		 410 aa  191  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  30.42 
 
 		 449 aa  191  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  30.35 
 
 		 461 aa  191  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  34.66 
 
 		 410 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  31.67 
 
 		 449 aa  189  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 420 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 420 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  34.15 
 
 		 409 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 420 aa  188  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 420 aa  189  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  34.65 
 
 		 420 aa  188  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  34.65 
 
 		 420 aa  188  4e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  34.66 
 
 		 410 aa  188  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  34.12 
 
 		 420 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  34.38 
 
 		 420 aa  187  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 420 aa  187  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.63 
 
 		 819 aa  187  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  29.76 
 
 		 471 aa  187  7e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  32.28 
 
 		 407 aa  187  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 420 aa  187  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 420 aa  187  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  34.38 
 
 		 420 aa  187  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  30.84 
 
 		 471 aa  187  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  30.47 
 
 		 471 aa  187  8e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4771  diaminopimelate decarboxylase  33.85 
 
 		 417 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  34.38 
 
 		 420 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  31.13 
 
 		 446 aa  187  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2691  diaminopimelate decarboxylase  34.82 
 
 		 419 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3181  diaminopimelate decarboxylase  33.95 
 
 		 420 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  34.29 
 
 		 420 aa  186  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  29.16 
 
 		 471 aa  186  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  32.27 
 
 		 823 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.08 
 
 		 819 aa  184  6e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  31.68 
 
 		 449 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  32.97 
 
 		 452 aa  183  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3166  diaminopimelate decarboxylase  35.56 
 
 		 413 aa  183  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.603838 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  34.64 
 
 		 433 aa  183  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2002  diaminopimelate decarboxylase  30.97 
 
 		 415 aa  182  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  31.32 
 
 		 406 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  30.91 
 
 		 406 aa  182  2.9999999999999997e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1818  diaminopimelate decarboxylase  36.04 
 
 		 431 aa  182  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0661432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  35.05 
 
 		 421 aa  181  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  31.66 
 
 		 410 aa  181  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  33.55 
 
 		 834 aa  181  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  31.47 
 
 		 449 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  33.24 
 
 		 434 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  31.47 
 
 		 449 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  31.47 
 
 		 449 aa  181  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  31.47 
 
 		 449 aa  180  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  28.15 
 
 		 456 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7089  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 413 aa  179  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  33.95 
 
 		 432 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  31.14 
 
 		 449 aa  178  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  31.14 
 
 		 449 aa  178  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  31.14 
 
 		 449 aa  178  5e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  31.14 
 
 		 449 aa  178  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  31.14 
 
 		 449 aa  178  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  32.69 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.72 
 
 		 835 aa  177  6e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  32.33 
 
 		 835 aa  177  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  29.51 
 
 		 437 aa  177  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  32.63 
 
 		 420 aa  177  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>