More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0670 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 453 aa  882    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  60.4 
 
 		 466 aa  502  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2740  diaminopimelate decarboxylase  55.74 
 
 		 411 aa  458  9.999999999999999e-129  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3166  diaminopimelate decarboxylase  56.88 
 
 		 413 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.603838 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2691  diaminopimelate decarboxylase  54.46 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2002  diaminopimelate decarboxylase  34.63 
 
 		 415 aa  236  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  37.3 
 
 		 412 aa  234  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  39.76 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  38.32 
 
 		 429 aa  233  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4771  diaminopimelate decarboxylase  37.3 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  36.18 
 
 		 412 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  34.51 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  36.7 
 
 		 420 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  36.2 
 
 		 420 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  36.2 
 
 		 420 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3483  diaminopimelate decarboxylase  37.3 
 
 		 412 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4883  diaminopimelate decarboxylase  37.3 
 
 		 412 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  36.62 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  36.62 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  36.2 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  36.62 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  36.62 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  36.62 
 
 		 420 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  36.38 
 
 		 420 aa  229  7e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5403  diaminopimelate decarboxylase  37.08 
 
 		 412 aa  229  7e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  36.38 
 
 		 420 aa  229  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  35.73 
 
 		 412 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7089  diaminopimelate decarboxylase  36.9 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  36.57 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  36.15 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  33.57 
 
 		 416 aa  227  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  36.38 
 
 		 420 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  37.41 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  36.83 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  32.3 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  38.92 
 
 		 432 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3181  diaminopimelate decarboxylase  35.75 
 
 		 420 aa  224  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  36.45 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  36.53 
 
 		 410 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  33.18 
 
 		 401 aa  218  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  36.36 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0753  diaminopimelate decarboxylase  35.88 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  36.36 
 
 		 425 aa  216  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0733  diaminopimelate decarboxylase  34.69 
 
 		 420 aa  216  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  33.73 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  35.24 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  37.62 
 
 		 421 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  37.13 
 
 		 421 aa  212  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  36.78 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  34.2 
 
 		 412 aa  211  2e-53  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0973  diaminopimelate decarboxylase  35.01 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  37.96 
 
 		 430 aa  211  3e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3248  diaminopimelate decarboxylase  35.01 
 
 		 420 aa  211  3e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1024  diaminopimelate decarboxylase  35.01 
 
 		 420 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  36.06 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  33.1 
 
 		 418 aa  209  9e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5726  diaminopimelate decarboxylase  34.93 
 
 		 416 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3486  diaminopimelate decarboxylase  33.87 
 
 		 420 aa  208  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  33.88 
 
 		 420 aa  207  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  40 
 
 		 878 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  32.55 
 
 		 401 aa  207  4e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  37.86 
 
 		 416 aa  207  4e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  36.84 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3625  diaminopimelate decarboxylase  33.41 
 
 		 420 aa  207  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  36.84 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  34.69 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  33.18 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  33.1 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  32.08 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  33.87 
 
 		 412 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  36.87 
 
 		 421 aa  204  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  29.82 
 
 		 410 aa  204  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  37.02 
 
 		 422 aa  203  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1818  diaminopimelate decarboxylase  34.01 
 
 		 431 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0661432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1645  diaminopimelate decarboxylase  34.72 
 
 		 416 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  37.61 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  32.32 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  37.19 
 
 		 850 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  34.58 
 
 		 434 aa  200  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  33.87 
 
 		 429 aa  200  5e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 434 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  31.75 
 
 		 398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  36.45 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  35.48 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  32.23 
 
 		 399 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  37.53 
 
 		 864 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  36.32 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  35.6 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  34.48 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  36.56 
 
 		 421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  36.02 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  31.46 
 
 		 402 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0083  diaminopimelate decarboxylase  33.77 
 
 		 432 aa  196  6e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822301 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  31.46 
 
 		 402 aa  196  7e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  36.38 
 
 		 421 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  34.58 
 
 		 434 aa  196  9e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  30.97 
 
 		 407 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  35.68 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  31.46 
 
 		 402 aa  194  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>