More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2942 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 430 aa  887    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  68.07 
 
 		 429 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  67.06 
 
 		 430 aa  579  1e-164  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  64.88 
 
 		 430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  61.57 
 
 		 433 aa  535  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  55.42 
 
 		 440 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  42.52 
 
 		 418 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  42.07 
 
 		 420 aa  311  2e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  39.35 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  39.14 
 
 		 423 aa  305  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  38.52 
 
 		 436 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  41.73 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  38.66 
 
 		 436 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  38.28 
 
 		 436 aa  300  4e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  41.79 
 
 		 451 aa  299  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  42.93 
 
 		 415 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  39.25 
 
 		 415 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  42.93 
 
 		 415 aa  296  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  41.24 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  40.98 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  42.45 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  40.98 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  37.5 
 
 		 436 aa  293  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  42.08 
 
 		 414 aa  293  4e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  42.96 
 
 		 415 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  42.96 
 
 		 415 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  40.98 
 
 		 419 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  38.97 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  41.49 
 
 		 415 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  39.14 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  39.11 
 
 		 425 aa  289  7e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  40.14 
 
 		 437 aa  289  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  40.98 
 
 		 422 aa  289  8e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  39.39 
 
 		 445 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  40.05 
 
 		 412 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  39.62 
 
 		 418 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  42.93 
 
 		 415 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  39.15 
 
 		 443 aa  286  7e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  39.33 
 
 		 414 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  42.69 
 
 		 415 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  39.09 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  37.26 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  41.69 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  41.69 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  41.69 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  38.39 
 
 		 416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  41.69 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  41.69 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  39.04 
 
 		 448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  41.69 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  42.75 
 
 		 415 aa  285  2.0000000000000002e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  37.14 
 
 		 417 aa  284  3.0000000000000004e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  39.33 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  39.45 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  40.4 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  40.55 
 
 		 423 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  38.12 
 
 		 445 aa  282  7.000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  41.19 
 
 		 423 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  40.5 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 417 aa  280  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  38.26 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  40.1 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  40.86 
 
 		 419 aa  278  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  37.91 
 
 		 434 aa  277  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  39.02 
 
 		 417 aa  277  2e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  40.73 
 
 		 420 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  37.17 
 
 		 414 aa  277  3e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  37.62 
 
 		 434 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  38.13 
 
 		 414 aa  276  6e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  36.38 
 
 		 417 aa  276  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  39.86 
 
 		 418 aa  276  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  40.55 
 
 		 418 aa  275  9e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  38.39 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  40.15 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  36.15 
 
 		 417 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  38.44 
 
 		 445 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  37.8 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  40.48 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1364  diaminopimelate decarboxylase  39.49 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.844058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  36.45 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1130  diaminopimelate decarboxylase  39.06 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.153124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  37.44 
 
 		 434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  38.85 
 
 		 414 aa  272  7e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  35.36 
 
 		 417 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  35.45 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  38.65 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  40.33 
 
 		 427 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  38.24 
 
 		 418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  40.18 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  39.05 
 
 		 414 aa  270  4e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  39.63 
 
 		 421 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  38.13 
 
 		 414 aa  270  4e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3606  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 		 420 aa  270  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00198954  hitchhiker  0.0000000450016 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  38.4 
 
 		 417 aa  270  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  39.81 
 
 		 427 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  39.76 
 
 		 417 aa  269  8e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  39.22 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2916  diaminopimelate decarboxylase  38.52 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0948953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>