More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3440 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 427 aa  863    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  51.57 
 
 		 415 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  47.47 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  46.06 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  46.41 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  47.47 
 
 		 416 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  50.72 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  48.43 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  50.73 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  48.32 
 
 		 419 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 414 aa  395  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  49.76 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  46.89 
 
 		 417 aa  388  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  47.13 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  51.33 
 
 		 414 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  46.99 
 
 		 417 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  47.87 
 
 		 418 aa  385  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  50.12 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  48.92 
 
 		 417 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  49.52 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  50.36 
 
 		 415 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  48.22 
 
 		 423 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  49.04 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  48.45 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 414 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  46.67 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  49.64 
 
 		 415 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  47.84 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  50.12 
 
 		 415 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  48.8 
 
 		 414 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  48.8 
 
 		 414 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  46.88 
 
 		 414 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  46.03 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  46.63 
 
 		 414 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  49.39 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  50.48 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  46.75 
 
 		 412 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  46.6 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  49.4 
 
 		 415 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  49.76 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  49.03 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  48.56 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  47.12 
 
 		 414 aa  376  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  46.88 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  49.04 
 
 		 414 aa  375  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  47.97 
 
 		 420 aa  374  1e-102  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  45.54 
 
 		 418 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  49.4 
 
 		 415 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  48.32 
 
 		 414 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  48.43 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  45.33 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  50 
 
 		 418 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  50.36 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 		 419 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  47.46 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  49.4 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  49.52 
 
 		 423 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  48.93 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  48.55 
 
 		 427 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  46.78 
 
 		 425 aa  369  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  48.07 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  47.95 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  47.02 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  46.79 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  47.1 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  48.07 
 
 		 427 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  48.68 
 
 		 418 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  47.83 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  48.07 
 
 		 416 aa  366  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  46.99 
 
 		 422 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  47.95 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  46.31 
 
 		 420 aa  365  1e-99  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  47.13 
 
 		 416 aa  365  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  47.34 
 
 		 421 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  46.89 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  47.96 
 
 		 422 aa  364  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  46.28 
 
 		 431 aa  363  3e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  46.88 
 
 		 419 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  46.88 
 
 		 419 aa  363  4e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  47.07 
 
 		 427 aa  363  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  46.62 
 
 		 407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  46.38 
 
 		 421 aa  362  9e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  46.05 
 
 		 431 aa  362  1e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  45.64 
 
 		 401 aa  362  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  46.41 
 
 		 421 aa  361  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  45.9 
 
 		 447 aa  359  4e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  47.13 
 
 		 421 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  46.51 
 
 		 422 aa  359  5e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  46.27 
 
 		 421 aa  359  7e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  46.27 
 
 		 421 aa  358  9e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  49.28 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0669  diaminopimelate decarboxylase  46.7 
 
 		 428 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  45.91 
 
 		 431 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  47.85 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  47.85 
 
 		 430 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>