More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0390 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  88.3 
 
 		 436 aa  790    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  75.12 
 
 		 435 aa  687    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  95.87 
 
 		 436 aa  858    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 436 aa  882    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  95.87 
 
 		 436 aa  852    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  41.9 
 
 		 416 aa  338  9e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  44.56 
 
 		 419 aa  332  8e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  40.23 
 
 		 422 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  41.78 
 
 		 420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  41.78 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  41.42 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  41.55 
 
 		 423 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  41.61 
 
 		 418 aa  323  4e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3116  diaminopimelate decarboxylase  41.65 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0675356 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  41.41 
 
 		 451 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  39.37 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  42.62 
 
 		 434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  42.86 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  43.52 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  41.38 
 
 		 445 aa  311  1e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  39.47 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  41.09 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  42.01 
 
 		 418 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  40.8 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  39.1 
 
 		 415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  39.03 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  39.03 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0992  diaminopimelate decarboxylase  38.89 
 
 		 427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  41.05 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  40.05 
 
 		 416 aa  304  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  38.39 
 
 		 414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  41.25 
 
 		 420 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  40.45 
 
 		 419 aa  302  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  41 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  39.6 
 
 		 417 aa  301  2e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  40.61 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  39.9 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  38.28 
 
 		 430 aa  300  4e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  39.61 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  39.16 
 
 		 443 aa  299  6e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  41.61 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  39.61 
 
 		 417 aa  299  7e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  39.02 
 
 		 430 aa  298  9e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  39.71 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  40.24 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  38.55 
 
 		 419 aa  297  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 417 aa  297  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  38.36 
 
 		 417 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  39.25 
 
 		 415 aa  296  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  38.8 
 
 		 427 aa  296  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  39.53 
 
 		 421 aa  296  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  39.02 
 
 		 423 aa  295  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3606  diaminopimelate decarboxylase  40.53 
 
 		 420 aa  295  9e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00198954  hitchhiker  0.0000000450016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  40.64 
 
 		 437 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  40.69 
 
 		 418 aa  295  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  39 
 
 		 414 aa  295  1e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  37.83 
 
 		 427 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 415 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  38.69 
 
 		 443 aa  294  2e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  40.68 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0083  diaminopimelate decarboxylase  42.58 
 
 		 432 aa  295  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  39.51 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  38.66 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0669  diaminopimelate decarboxylase  38.8 
 
 		 428 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  39.5 
 
 		 440 aa  293  4e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2916  diaminopimelate decarboxylase  39.19 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0948953  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 415 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  38.31 
 
 		 427 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 415 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 415 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  39.16 
 
 		 427 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  37.92 
 
 		 415 aa  291  1e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  38.5 
 
 		 417 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  37.29 
 
 		 415 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  39.52 
 
 		 422 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  38.63 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  38.63 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  38.63 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  38.35 
 
 		 430 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  38.63 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  38.63 
 
 		 423 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  38.63 
 
 		 423 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  37.5 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  37.29 
 
 		 415 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  38.39 
 
 		 415 aa  288  9e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  38.88 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  38.39 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  39.51 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  39.41 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  38.5 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  40.28 
 
 		 445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  38.59 
 
 		 416 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  37.74 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2176  diaminopimelate decarboxylase  40.93 
 
 		 430 aa  286  4e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  37.29 
 
 		 415 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  37.2 
 
 		 425 aa  286  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  39.41 
 
 		 416 aa  286  5e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  38.22 
 
 		 421 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  38.27 
 
 		 417 aa  286  7e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  38.07 
 
 		 414 aa  285  9e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>