More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0402 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  74.05 
 
 		 864 aa  1283    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.48 
 
 		 859 aa  697    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.25 
 
 		 859 aa  694    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  76.8 
 
 		 850 aa  1337    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0461  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  98.39 
 
 		 868 aa  1736    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0402  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  100 
 
 		 868 aa  1763    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  43.87 
 
 		 857 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  48.51 
 
 		 878 aa  759    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  37.38 
 
 		 466 aa  216  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  31.62 
 
 		 454 aa  206  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  32.52 
 
 		 416 aa  206  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  31.53 
 
 		 469 aa  204  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  36.78 
 
 		 402 aa  204  8e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  30.6 
 
 		 458 aa  203  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  31.65 
 
 		 455 aa  203  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  35.19 
 
 		 410 aa  202  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  30.6 
 
 		 458 aa  202  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  30.24 
 
 		 455 aa  201  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  30.86 
 
 		 471 aa  201  7e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  34.94 
 
 		 410 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  30.9 
 
 		 450 aa  197  6e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  34.68 
 
 		 410 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  33.92 
 
 		 449 aa  197  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  30.13 
 
 		 450 aa  197  9e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  34.04 
 
 		 425 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  35.22 
 
 		 412 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  31.77 
 
 		 471 aa  196  1e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  34.21 
 
 		 420 aa  195  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  34.47 
 
 		 420 aa  195  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  34.47 
 
 		 420 aa  194  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0299  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.68 
 
 		 819 aa  195  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  34.95 
 
 		 421 aa  194  5e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  34.21 
 
 		 420 aa  194  6e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  34.21 
 
 		 420 aa  194  6e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  28.16 
 
 		 471 aa  194  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  34.21 
 
 		 420 aa  194  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  34.21 
 
 		 420 aa  194  6e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  34.21 
 
 		 420 aa  194  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  34.21 
 
 		 420 aa  193  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3483  diaminopimelate decarboxylase  34.7 
 
 		 412 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4883  diaminopimelate decarboxylase  34.7 
 
 		 412 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  31.03 
 
 		 461 aa  192  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  30.54 
 
 		 471 aa  191  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  34.19 
 
 		 412 aa  191  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  30.82 
 
 		 461 aa  191  5e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5403  diaminopimelate decarboxylase  34.45 
 
 		 412 aa  191  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  34.77 
 
 		 421 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  34.22 
 
 		 420 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  30.56 
 
 		 449 aa  190  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  34.22 
 
 		 420 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  30.6 
 
 		 461 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  33.95 
 
 		 420 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  29.76 
 
 		 437 aa  189  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  33.95 
 
 		 420 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1983  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.59 
 
 		 819 aa  188  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0259928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  34.41 
 
 		 434 aa  189  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  35.84 
 
 		 453 aa  188  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0264  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.79 
 
 		 819 aa  187  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0271796 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2740  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 		 411 aa  187  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  33.12 
 
 		 456 aa  187  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  29.03 
 
 		 451 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  29.77 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  29.81 
 
 		 440 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  35.36 
 
 		 386 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  34.51 
 
 		 409 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  30.75 
 
 		 449 aa  186  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  33.93 
 
 		 412 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  33.95 
 
 		 420 aa  186  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.78 
 
 		 815 aa  185  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  32.21 
 
 		 452 aa  185  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3181  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 		 420 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  32.76 
 
 		 451 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  32.76 
 
 		 451 aa  184  6e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  32.31 
 
 		 450 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  32.76 
 
 		 451 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  32.76 
 
 		 459 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  31.2 
 
 		 471 aa  183  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2703  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  31.7 
 
 		 823 aa  183  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  32.83 
 
 		 451 aa  183  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  32.98 
 
 		 451 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  30.44 
 
 		 814 aa  182  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  32.31 
 
 		 451 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4771  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 417 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  28.48 
 
 		 456 aa  181  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5726  diaminopimelate decarboxylase  32.9 
 
 		 416 aa  181  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  32.53 
 
 		 451 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  33.6 
 
 		 420 aa  181  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  32.76 
 
 		 451 aa  181  8e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  32.76 
 
 		 451 aa  181  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  32.37 
 
 		 424 aa  180  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.17 
 
 		 820 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 412 aa  179  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  31.78 
 
 		 410 aa  179  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1818  diaminopimelate decarboxylase  35.37 
 
 		 431 aa  179  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0661432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7089  diaminopimelate decarboxylase  34.01 
 
 		 413 aa  179  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.61 
 
 		 820 aa  179  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  33.48 
 
 		 452 aa  178  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  34.07 
 
 		 386 aa  178  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  28.51 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.4 
 
 		 820 aa  177  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>