More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1362 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 401 aa  810    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  72.82 
 
 		 402 aa  601  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  72.82 
 
 		 402 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  72.57 
 
 		 402 aa  599  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  64.68 
 
 		 407 aa  523  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  63.83 
 
 		 412 aa  521  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  63.91 
 
 		 399 aa  523  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  63.8 
 
 		 401 aa  507  9.999999999999999e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  61.88 
 
 		 403 aa  500  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  57.96 
 
 		 403 aa  475  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  45.11 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  44.53 
 
 		 412 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  49.22 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  45.18 
 
 		 427 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  45.52 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  45.18 
 
 		 427 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  46.08 
 
 		 423 aa  358  8e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 		 434 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  43.15 
 
 		 416 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  48.58 
 
 		 419 aa  354  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  48.21 
 
 		 420 aa  354  2e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  47.33 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  43.73 
 
 		 422 aa  352  5e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  47.3 
 
 		 414 aa  350  4e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 		 418 aa  348  8e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  46.68 
 
 		 416 aa  348  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  45.48 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  45.27 
 
 		 417 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  47.67 
 
 		 414 aa  346  4e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  47.64 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  47.38 
 
 		 414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  45.04 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 		 419 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 		 419 aa  342  5e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  47.68 
 
 		 414 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  45.01 
 
 		 423 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  47.12 
 
 		 414 aa  340  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  44.76 
 
 		 417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  46.74 
 
 		 414 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  45.69 
 
 		 414 aa  340  4e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  46.13 
 
 		 415 aa  340  4e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  47.26 
 
 		 414 aa  340  4e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  45.25 
 
 		 427 aa  339  5e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  44.9 
 
 		 415 aa  338  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  45.66 
 
 		 415 aa  338  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  45.01 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  45.15 
 
 		 415 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  46.29 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  44.9 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  45.52 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  43.94 
 
 		 421 aa  335  5.999999999999999e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  45.43 
 
 		 434 aa  335  7e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  45.43 
 
 		 445 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  42.09 
 
 		 415 aa  335  9e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  44.39 
 
 		 417 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  45.81 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  45.08 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  43.11 
 
 		 416 aa  333  3e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  45.55 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  43.99 
 
 		 415 aa  332  6e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  45.01 
 
 		 415 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  43.73 
 
 		 415 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  45.15 
 
 		 418 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  44.9 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  44.25 
 
 		 414 aa  329  6e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  44.25 
 
 		 451 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  44.13 
 
 		 415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  43.78 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  44.78 
 
 		 418 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  41.07 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  45.01 
 
 		 415 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  43.69 
 
 		 420 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  45.1 
 
 		 416 aa  326  6e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  44.64 
 
 		 417 aa  326  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  43.62 
 
 		 423 aa  325  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  41.33 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  43.75 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  44.44 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  43.6 
 
 		 415 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  44.1 
 
 		 419 aa  323  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  44.76 
 
 		 443 aa  323  3e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  44.39 
 
 		 421 aa  323  3e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  44.19 
 
 		 422 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  45.17 
 
 		 414 aa  322  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  42.07 
 
 		 432 aa  323  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  46.09 
 
 		 415 aa  322  8e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  43.25 
 
 		 422 aa  321  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  42.75 
 
 		 419 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  46.34 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  39.5 
 
 		 425 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  46.34 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 		 445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  43.69 
 
 		 420 aa  319  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  43.04 
 
 		 421 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  42.68 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  44.76 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  42.68 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  46.07 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  46.07 
 
 		 414 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  46.07 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>