More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0790 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 385 aa  759    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  48.95 
 
 		 394 aa  345  8.999999999999999e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0798  diaminopimelate decarboxylase  47.71 
 
 		 393 aa  314  9.999999999999999e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 403 aa  224  2e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  34.59 
 
 		 419 aa  224  3e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  39.19 
 
 		 416 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  39.8 
 
 		 427 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  37.56 
 
 		 386 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 382 aa  219  5e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  38.25 
 
 		 429 aa  219  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  38.24 
 
 		 432 aa  218  1e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  35.24 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  36.36 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  36.96 
 
 		 466 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  36.95 
 
 		 386 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  39.65 
 
 		 422 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  35.53 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  33.67 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  34.17 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  34.26 
 
 		 402 aa  212  7.999999999999999e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  37.84 
 
 		 430 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  34.76 
 
 		 401 aa  212  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  34.68 
 
 		 399 aa  211  2e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  34.26 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  35.09 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  38.06 
 
 		 445 aa  211  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  32.67 
 
 		 430 aa  211  2e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  38.88 
 
 		 422 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  41.38 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  36.43 
 
 		 417 aa  209  4e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  34.58 
 
 		 434 aa  209  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  36.05 
 
 		 430 aa  209  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  35.68 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  38.06 
 
 		 423 aa  209  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  34.26 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  36.05 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  35.25 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  32.24 
 
 		 393 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  37.66 
 
 		 416 aa  206  4e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  35.64 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0083  diaminopimelate decarboxylase  37.75 
 
 		 432 aa  206  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  35.18 
 
 		 416 aa  206  7e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  35.31 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  36.3 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  38.21 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  36.03 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  37.35 
 
 		 419 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  36.39 
 
 		 421 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  36.41 
 
 		 435 aa  204  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 423 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 423 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 423 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 423 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 423 aa  202  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 423 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  31.31 
 
 		 407 aa  202  6e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  38.67 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  35.38 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  38.24 
 
 		 419 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  38.24 
 
 		 419 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  33.75 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  37.78 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  37.68 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  32.66 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  36.45 
 
 		 418 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  38.15 
 
 		 423 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  38.75 
 
 		 451 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  37.28 
 
 		 415 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 		 416 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  35.28 
 
 		 419 aa  199  6e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  37.81 
 
 		 427 aa  199  7e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2176  diaminopimelate decarboxylase  36.88 
 
 		 430 aa  199  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  34.3 
 
 		 421 aa  199  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  38.06 
 
 		 420 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  34.41 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  35.95 
 
 		 421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  36.78 
 
 		 416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  32.59 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  34.64 
 
 		 443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  34.41 
 
 		 421 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  37.53 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  35.19 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  34.65 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  32.66 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  34.26 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  34.5 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  37.93 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  34.8 
 
 		 421 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 		 417 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  37.5 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  38.24 
 
 		 415 aa  196  6e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 415 aa  196  6e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  31.83 
 
 		 424 aa  196  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  35.35 
 
 		 443 aa  196  6e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  36.3 
 
 		 425 aa  196  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  34.34 
 
 		 418 aa  196  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>