More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0318 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 394 aa  784    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0798  diaminopimelate decarboxylase  66.84 
 
 		 393 aa  486  1e-136  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  48.68 
 
 		 385 aa  334  2e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  38.93 
 
 		 416 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  34.18 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  33.67 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  34.43 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  33.59 
 
 		 399 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  32.83 
 
 		 420 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  38.89 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  38.89 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  33.77 
 
 		 419 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  32.91 
 
 		 420 aa  219  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  32.33 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  35.18 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  32.66 
 
 		 407 aa  218  2e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  34.25 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  32.75 
 
 		 403 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  35.01 
 
 		 430 aa  216  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  35.09 
 
 		 445 aa  215  9e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  32.41 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  35.44 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  35.4 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  35.43 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  35.28 
 
 		 430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  36.27 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  36.75 
 
 		 422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  35.68 
 
 		 434 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  32.9 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  34.72 
 
 		 429 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  34.33 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  34.76 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  34.51 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  36.87 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  34.67 
 
 		 423 aa  210  4e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  36.27 
 
 		 417 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  34.33 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  33.93 
 
 		 421 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  36.27 
 
 		 402 aa  207  3e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  35.61 
 
 		 415 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  33.59 
 
 		 418 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  37.11 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  33.93 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  38.07 
 
 		 423 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  36.62 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  36.62 
 
 		 415 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  36.14 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  34.78 
 
 		 418 aa  206  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  35.51 
 
 		 414 aa  206  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  36.62 
 
 		 415 aa  206  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  33.93 
 
 		 421 aa  206  8e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  31.96 
 
 		 407 aa  205  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  35.21 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  32.4 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  35.35 
 
 		 415 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  32.39 
 
 		 421 aa  204  3e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  33.67 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  31.82 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  32.41 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0083  diaminopimelate decarboxylase  33.92 
 
 		 432 aa  203  5e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822301 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  32.32 
 
 		 416 aa  203  5e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  34.53 
 
 		 417 aa  203  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  36.27 
 
 		 425 aa  202  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  32.14 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  34.19 
 
 		 422 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  37.69 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  32.32 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  31.99 
 
 		 403 aa  201  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  36.78 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  34 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 427 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  35.31 
 
 		 421 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  35 
 
 		 417 aa  199  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  33.92 
 
 		 427 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  34.09 
 
 		 447 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  33.83 
 
 		 421 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  32.14 
 
 		 402 aa  199  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  34.52 
 
 		 417 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  36.36 
 
 		 415 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  34.99 
 
 		 386 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 416 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  34.17 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  34.55 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  36.27 
 
 		 415 aa  197  3e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  31.17 
 
 		 417 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  31.23 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  35.12 
 
 		 420 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  33.93 
 
 		 445 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  34.81 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  32.13 
 
 		 409 aa  196  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  31.66 
 
 		 416 aa  196  6e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 		 414 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  32.39 
 
 		 421 aa  196  7e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  34 
 
 		 417 aa  196  8.000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  33.68 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  30.21 
 
 		 398 aa  196  8.000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  35.38 
 
 		 415 aa  195  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>