More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1348 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 416 aa  852    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  74.76 
 
 		 417 aa  646    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  74.28 
 
 		 417 aa  646    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  74.15 
 
 		 435 aa  644    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  71.22 
 
 		 418 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  65.38 
 
 		 416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  64.66 
 
 		 416 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  47.07 
 
 		 412 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  45.12 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  45.15 
 
 		 416 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  44.39 
 
 		 419 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  46.34 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  45.61 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  45.85 
 
 		 417 aa  356  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  46.28 
 
 		 425 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  45.18 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  44.9 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  43.41 
 
 		 417 aa  351  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  41.85 
 
 		 418 aa  348  9e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  42.93 
 
 		 423 aa  347  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  44.42 
 
 		 419 aa  345  8.999999999999999e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  43.99 
 
 		 418 aa  342  5e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  44.15 
 
 		 416 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  45.37 
 
 		 415 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  43.9 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  45.12 
 
 		 415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  42.68 
 
 		 414 aa  336  5e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 422 aa  336  5e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  44.77 
 
 		 415 aa  336  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  41.75 
 
 		 445 aa  335  7e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  42.44 
 
 		 417 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  44.77 
 
 		 415 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 414 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 414 aa  332  7.000000000000001e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  41.95 
 
 		 414 aa  332  9e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 414 aa  332  9e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  45.99 
 
 		 415 aa  332  1e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  41.49 
 
 		 418 aa  330  3e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  43.41 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  43.41 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 427 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  44.28 
 
 		 415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  41.12 
 
 		 416 aa  329  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  44.1 
 
 		 415 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  44.34 
 
 		 415 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  44.58 
 
 		 415 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  41.73 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  43.9 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  42.48 
 
 		 434 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  42.93 
 
 		 421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 427 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  42.96 
 
 		 427 aa  327  3e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  41.36 
 
 		 421 aa  326  5e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  43.8 
 
 		 451 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  42.48 
 
 		 417 aa  325  7e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  42.44 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  42.23 
 
 		 417 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  42.58 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  41.73 
 
 		 422 aa  323  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  41.87 
 
 		 443 aa  323  5e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  41.12 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  44.82 
 
 		 415 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  43.8 
 
 		 418 aa  322  8e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  43.93 
 
 		 422 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  41.46 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  42.09 
 
 		 422 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  42.24 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  40.73 
 
 		 414 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  41.93 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  40.98 
 
 		 414 aa  319  6e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  42.09 
 
 		 421 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  37.56 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  41.63 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  42.82 
 
 		 412 aa  318  1e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  40.49 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  41.55 
 
 		 421 aa  317  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  39.9 
 
 		 420 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  43.2 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  41.71 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  42.34 
 
 		 421 aa  316  6e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  39.71 
 
 		 417 aa  316  6e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  40.15 
 
 		 421 aa  315  7e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  40.15 
 
 		 421 aa  315  7e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  41.36 
 
 		 421 aa  315  8e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  41.87 
 
 		 422 aa  314  9.999999999999999e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  41.69 
 
 		 422 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  42.96 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  41.12 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  40.88 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  40.34 
 
 		 421 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0666  diaminopimelate decarboxylase  39.53 
 
 		 434 aa  313  2.9999999999999996e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  41.39 
 
 		 420 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  40.63 
 
 		 421 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  42.23 
 
 		 415 aa  313  4.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  42.68 
 
 		 430 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  38.81 
 
 		 447 aa  312  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>