More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0798 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0798  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 393 aa  790    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  66.84 
 
 		 394 aa  512  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  47.23 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.867864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  34.84 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  33.76 
 
 		 419 aa  223  6e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  37.41 
 
 		 416 aa  222  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  34.92 
 
 		 417 aa  222  8e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  34.67 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  36.36 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  33.76 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  34.96 
 
 		 429 aa  213  5.999999999999999e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  34.67 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  32.99 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  33.83 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  33.75 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  36.52 
 
 		 419 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  34.18 
 
 		 435 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  32.65 
 
 		 402 aa  202  7e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  32.32 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  33.92 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  33 
 
 		 416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  36.2 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  32.39 
 
 		 402 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  34.11 
 
 		 386 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  34.17 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  35.63 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  34.48 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 		 401 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 		 412 aa  196  7e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  33.68 
 
 		 386 aa  195  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  33.75 
 
 		 425 aa  195  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  31.65 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  34.09 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  35.18 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  32.68 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  31.63 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  30.23 
 
 		 416 aa  192  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 423 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  30.98 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  34.66 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  32.32 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  35.35 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  32.25 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  30.47 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  32.68 
 
 		 430 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  34.25 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  32.99 
 
 		 445 aa  189  5e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  32.04 
 
 		 401 aa  189  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  33.08 
 
 		 421 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  33.16 
 
 		 421 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 421 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  33.75 
 
 		 432 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.52 
 
 		 859 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  33.24 
 
 		 859 aa  188  1e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  32.36 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  36.04 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  30.3 
 
 		 407 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  36.04 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  31.36 
 
 		 403 aa  186  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  34.17 
 
 		 421 aa  186  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  33.25 
 
 		 427 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  34.34 
 
 		 440 aa  186  8e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  33.75 
 
 		 425 aa  186  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0083  diaminopimelate decarboxylase  33.83 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822301 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  34.22 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  34.34 
 
 		 412 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2916  diaminopimelate decarboxylase  34.53 
 
 		 433 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0948953  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  34.67 
 
 		 419 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  34.17 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  31.14 
 
 		 423 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  32.99 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  32.67 
 
 		 429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  32.17 
 
 		 432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  35.06 
 
 		 417 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  33.42 
 
 		 415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  33.92 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  32.65 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  33.67 
 
 		 445 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  32.41 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  32.99 
 
 		 427 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  35.78 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  36.03 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  31.63 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  34.59 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  33.5 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  38.21 
 
 		 878 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  35.54 
 
 		 410 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  32.66 
 
 		 421 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  32.84 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  29.93 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  34.59 
 
 		 431 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  32.59 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  31.66 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>