More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2472 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 412 aa  832    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  42.16 
 
 		 418 aa  329  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  42.72 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  41.45 
 
 		 443 aa  321  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  37.96 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  40.72 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  39.8 
 
 		 417 aa  318  7.999999999999999e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  39.9 
 
 		 445 aa  315  8e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  40.14 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  40.44 
 
 		 421 aa  314  9.999999999999999e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  39.42 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  37.71 
 
 		 419 aa  315  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  40 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  39.22 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  40.58 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  39.86 
 
 		 417 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  41.91 
 
 		 419 aa  311  1e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  39.51 
 
 		 417 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  38.7 
 
 		 421 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  39.75 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  38.73 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  38.69 
 
 		 421 aa  309  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  38.69 
 
 		 421 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  36.52 
 
 		 414 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  39.42 
 
 		 414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  38.98 
 
 		 421 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  39.17 
 
 		 445 aa  307  3e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  37.07 
 
 		 451 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  39.46 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  39.23 
 
 		 414 aa  306  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  37.25 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  38.73 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  37.14 
 
 		 423 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  39.22 
 
 		 414 aa  306  6e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  37.07 
 
 		 416 aa  305  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  39.42 
 
 		 417 aa  305  8.000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  37.8 
 
 		 419 aa  305  9.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  37.99 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  37.9 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  37.99 
 
 		 421 aa  305  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  39.22 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  39.71 
 
 		 417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  38.55 
 
 		 418 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  38.73 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  38.97 
 
 		 415 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  38.54 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  37.14 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  37.9 
 
 		 417 aa  302  6.000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  37.14 
 
 		 420 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  37.35 
 
 		 423 aa  302  7.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  37.5 
 
 		 414 aa  302  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  37.41 
 
 		 434 aa  302  8.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  36.26 
 
 		 447 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  38.14 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  39.51 
 
 		 421 aa  301  1e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  37.41 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  37.75 
 
 		 415 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  38.78 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  38.2 
 
 		 416 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  37.25 
 
 		 423 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  36.74 
 
 		 419 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0666  diaminopimelate decarboxylase  37.09 
 
 		 434 aa  299  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  36.1 
 
 		 414 aa  299  5e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  35.73 
 
 		 425 aa  299  6e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  39.76 
 
 		 420 aa  298  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  38.69 
 
 		 422 aa  298  9e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  38.54 
 
 		 427 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  38.14 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  37.5 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  37.5 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  37.5 
 
 		 414 aa  298  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  37.71 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  37.5 
 
 		 415 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  38.29 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  37.32 
 
 		 414 aa  297  3e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  37.01 
 
 		 415 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  36.27 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  37.75 
 
 		 430 aa  296  5e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  36.96 
 
 		 423 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  38.05 
 
 		 415 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  36.86 
 
 		 422 aa  295  8e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  37.99 
 
 		 415 aa  295  9e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  37.75 
 
 		 422 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  38.54 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  35.78 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  40.33 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  37.26 
 
 		 431 aa  294  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  37.29 
 
 		 420 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  37.56 
 
 		 432 aa  293  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  36.74 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5498  diaminopimelate decarboxylase  38.48 
 
 		 415 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  36.83 
 
 		 417 aa  293  3e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  36.71 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  38.05 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  36.71 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  36.71 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  36.71 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  38.05 
 
 		 415 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  36.71 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  36.71 
 
 		 423 aa  293  4e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>