More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0666 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0666  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 434 aa  892    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  50.35 
 
 		 429 aa  451  1e-125  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  47.59 
 
 		 422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  48.39 
 
 		 425 aa  399  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  46.21 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  47.48 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  47.67 
 
 		 422 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  47.33 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  46.9 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  45.16 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  46.56 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  47.33 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  47.45 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  44.83 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  44.47 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  44.7 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  45.94 
 
 		 419 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  49.41 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  43.78 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  45.52 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  45.29 
 
 		 422 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  46.21 
 
 		 431 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  45.75 
 
 		 421 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  45.75 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  46 
 
 		 422 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0050  diaminopimelate decarboxylase  48.62 
 
 		 423 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  47.78 
 
 		 418 aa  378  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  45.75 
 
 		 421 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  45.66 
 
 		 421 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  50 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  45.41 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  45.71 
 
 		 417 aa  373  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  45.52 
 
 		 421 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  46.05 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  46.76 
 
 		 417 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  46.31 
 
 		 434 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  47.56 
 
 		 414 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  46.87 
 
 		 416 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  45.81 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  44.14 
 
 		 422 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  47.98 
 
 		 423 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  45.33 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  47 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  44.6 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  47.58 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  44.57 
 
 		 416 aa  369  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  45.98 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  45.39 
 
 		 416 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  46.76 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4848  diaminopimelate decarboxylase  44.83 
 
 		 423 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  44.78 
 
 		 434 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2123  diaminopimelate decarboxylase  45.54 
 
 		 422 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  47.51 
 
 		 423 aa  368  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  45.69 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  45.54 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  45.66 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3410  diaminopimelate decarboxylase  47.71 
 
 		 422 aa  368  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000272348 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  46.28 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 		 421 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4044  diaminopimelate decarboxylase  47.6 
 
 		 422 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  48.74 
 
 		 420 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  47.66 
 
 		 423 aa  363  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  45.75 
 
 		 421 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  43.68 
 
 		 422 aa  362  9e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  44.68 
 
 		 415 aa  361  2e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  44.08 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  46.87 
 
 		 415 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  44.95 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  44.27 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  44.27 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  44.95 
 
 		 419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  46.64 
 
 		 415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  47.7 
 
 		 420 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0992  diaminopimelate decarboxylase  44.88 
 
 		 427 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  43.12 
 
 		 423 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  46.98 
 
 		 415 aa  355  6.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  46.26 
 
 		 418 aa  355  6.999999999999999e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  46.42 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  46.42 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  46.42 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  46.42 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  46.42 
 
 		 423 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  46.42 
 
 		 423 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  46.99 
 
 		 415 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  46.42 
 
 		 423 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3031  diaminopimelate decarboxylase  46.19 
 
 		 423 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  44.04 
 
 		 422 aa  352  5.9999999999999994e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  46.31 
 
 		 420 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  47.07 
 
 		 419 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  46.53 
 
 		 415 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  44.06 
 
 		 431 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  43.36 
 
 		 415 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  44.06 
 
 		 431 aa  350  3e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  41.28 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  42.33 
 
 		 414 aa  350  3e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  43.16 
 
 		 414 aa  349  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  45.33 
 
 		 432 aa  350  4e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  46.53 
 
 		 415 aa  349  5e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  44.6 
 
 		 414 aa  349  7e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  44.44 
 
 		 443 aa  348  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>