131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0152 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 
378 aa  787    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  51.57 
 
 
385 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  52.29 
 
 
386 aa  417  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  49.33 
 
 
375 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  51.59 
 
 
376 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  48.73 
 
 
408 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  46.81 
 
 
376 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  49.6 
 
 
397 aa  358  6e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  45.26 
 
 
380 aa  348  8e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  47.45 
 
 
400 aa  347  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  47.18 
 
 
384 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  46.54 
 
 
384 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  44.03 
 
 
379 aa  343  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  46.48 
 
 
399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  45.58 
 
 
384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  45.53 
 
 
378 aa  338  8e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  43.58 
 
 
382 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  45.31 
 
 
384 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  42.86 
 
 
382 aa  335  7.999999999999999e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  45.84 
 
 
384 aa  334  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  42.29 
 
 
379 aa  333  3e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  44.62 
 
 
392 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  41.51 
 
 
382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  41.51 
 
 
382 aa  324  2e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  45.97 
 
 
380 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  40.99 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.59 
 
 
387 aa  318  9e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  38.68 
 
 
377 aa  315  8e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  41.41 
 
 
406 aa  310  4e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  42.41 
 
 
391 aa  309  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  41.1 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  40.62 
 
 
389 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  41.88 
 
 
390 aa  301  1e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  36.91 
 
 
387 aa  299  4e-80  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  37.93 
 
 
408 aa  293  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  40.05 
 
 
405 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.21 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.68 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.4 
 
 
390 aa  266  5e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.92 
 
 
390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  34.32 
 
 
365 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  34.85 
 
 
365 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  34.85 
 
 
365 aa  231  2e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  35.12 
 
 
365 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  34.05 
 
 
389 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  35.28 
 
 
381 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  34.15 
 
 
365 aa  222  7e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  34.22 
 
 
365 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  34.22 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  34.49 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  35.29 
 
 
387 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  34.22 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  34.22 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  35.29 
 
 
376 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  35.56 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  35.29 
 
 
365 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  33.95 
 
 
377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  32.71 
 
 
365 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  34.58 
 
 
377 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.57 
 
 
414 aa  209  5e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  34.22 
 
 
365 aa  208  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.31 
 
 
417 aa  208  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  33.69 
 
 
365 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  32.37 
 
 
379 aa  205  9e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.55 
 
 
1055 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.91 
 
 
1076 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.55 
 
 
1058 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.55 
 
 
1086 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.55 
 
 
1113 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.55 
 
 
1110 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  31.91 
 
 
1134 aa  186  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  31.58 
 
 
375 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  26.74 
 
 
416 aa  63.5  0.000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  23.84 
 
 
878 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  22.98 
 
 
416 aa  59.7  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  27.07 
 
 
417 aa  57  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  23.66 
 
 
386 aa  56.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  26.33 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21592  diaminopimelate decarboxylase  23.23 
 
 
481 aa  55.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  26.96 
 
 
417 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  22.58 
 
 
857 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  24.49 
 
 
434 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0693  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.21 
 
 
379 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  26.05 
 
 
417 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  22.22 
 
 
430 aa  54.3  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
382 aa  53.5  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  20.51 
 
 
425 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  24.52 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  24.53 
 
 
415 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  22.75 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  24.91 
 
 
447 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  22.67 
 
 
421 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  26.28 
 
 
412 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  21.45 
 
 
850 aa  50.4  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
414 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  22.62 
 
 
421 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  25.19 
 
 
414 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0083  diaminopimelate decarboxylase  25.66 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822301 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  26.1 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  22.78 
 
 
421 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>