126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2319 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 389 aa  804    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  64.23 
 
 		 391 aa  508  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  62.09 
 
 		 390 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  61.52 
 
 		 405 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  61.5 
 
 		 400 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  60.7 
 
 		 384 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  58.9 
 
 		 406 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  59.84 
 
 		 378 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  58.56 
 
 		 384 aa  461  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  58.29 
 
 		 397 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  57.75 
 
 		 384 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  55.29 
 
 		 376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  57.77 
 
 		 399 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  56.61 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  56.61 
 
 		 384 aa  450  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  53.95 
 
 		 382 aa  441  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  55.24 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  51.42 
 
 		 387 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  51.83 
 
 		 379 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  50.51 
 
 		 408 aa  393  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  48.82 
 
 		 382 aa  384  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.59 
 
 		 399 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.56 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.86 
 
 		 390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  47.75 
 
 		 375 aa  358  9e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  44.04 
 
 		 385 aa  358  9.999999999999999e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  47.48 
 
 		 376 aa  358  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  46.42 
 
 		 386 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  43.98 
 
 		 379 aa  352  5e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  47.61 
 
 		 380 aa  343  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  43.31 
 
 		 380 aa  341  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  45.23 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  40.31 
 
 		 382 aa  324  2e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.24 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  40.05 
 
 		 382 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  39.79 
 
 		 382 aa  319  6e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  40.1 
 
 		 387 aa  311  2e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  37.96 
 
 		 377 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  38.44 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  40.62 
 
 		 378 aa  304  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  41.53 
 
 		 365 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  41.27 
 
 		 365 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  42.33 
 
 		 389 aa  282  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  39.74 
 
 		 379 aa  279  6e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  38.89 
 
 		 365 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  38.89 
 
 		 365 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  38.89 
 
 		 365 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  38.89 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  38.99 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  41.64 
 
 		 365 aa  273  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  38.2 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  41.76 
 
 		 365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  40.63 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  41.49 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  41.22 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  39.52 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  37.04 
 
 		 365 aa  249  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  35.98 
 
 		 387 aa  249  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  35.09 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.38 
 
 		 417 aa  244  9.999999999999999e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.14 
 
 		 414 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  34.73 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  34.83 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  34.55 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.3 
 
 		 1055 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.83 
 
 		 1113 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.3 
 
 		 1086 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.83 
 
 		 1058 aa  193  4e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.83 
 
 		 1076 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.83 
 
 		 1110 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.83 
 
 		 1134 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  32.46 
 
 		 375 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0771  diaminopimelate decarboxylase  22.52 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.129495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1791  diaminopimelate decarboxylase  24.57 
 
 		 423 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  22.67 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  23.96 
 
 		 421 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  23.02 
 
 		 416 aa  51.6  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  22.96 
 
 		 421 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  25.38 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  24.05 
 
 		 384 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  23.26 
 
 		 435 aa  50.4  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  23.02 
 
 		 427 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1011  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  25.9 
 
 		 864 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834007  normal  0.825142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  27.78 
 
 		 427 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  21.39 
 
 		 439 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  19.75 
 
 		 406 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  24.19 
 
 		 427 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  21.38 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  23.51 
 
 		 420 aa  49.3  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  23.8 
 
 		 417 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  23.43 
 
 		 421 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  23.77 
 
 		 850 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2691  diaminopimelate decarboxylase  23.9 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4745  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.53 
 
 		 582 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  25.09 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  26.16 
 
 		 421 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  23.38 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  23.8 
 
 		 421 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  24.51 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  24.51 
 
 		 414 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>