244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1556 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 
376 aa  779    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  72.61 
 
 
382 aa  597  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  63.3 
 
 
379 aa  528  1e-149  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  60.64 
 
 
378 aa  495  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  59.53 
 
 
399 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  56.4 
 
 
391 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  55.29 
 
 
389 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  57.87 
 
 
384 aa  451  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  55.91 
 
 
387 aa  451  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  56.87 
 
 
384 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  57.33 
 
 
400 aa  443  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  57.14 
 
 
384 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  54.07 
 
 
390 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  56.6 
 
 
397 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  53.63 
 
 
385 aa  431  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  55.53 
 
 
384 aa  432  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  55.53 
 
 
384 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  53.79 
 
 
405 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  55.41 
 
 
392 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  53.4 
 
 
382 aa  415  9.999999999999999e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  50.77 
 
 
408 aa  415  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  51.19 
 
 
380 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  52.12 
 
 
379 aa  414  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  53.49 
 
 
386 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  49.87 
 
 
406 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  52.01 
 
 
380 aa  387  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  49.87 
 
 
376 aa  380  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  45.97 
 
 
382 aa  376  1e-103  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  47.63 
 
 
377 aa  375  1e-103  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  46.23 
 
 
382 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.55 
 
 
390 aa  372  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  45.71 
 
 
382 aa  372  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  46.92 
 
 
375 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  45.04 
 
 
408 aa  365  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  47.36 
 
 
400 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  45.41 
 
 
387 aa  362  6e-99  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.77 
 
 
399 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  46.81 
 
 
378 aa  360  3e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.8 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.38 
 
 
390 aa  337  9.999999999999999e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  41.67 
 
 
379 aa  278  8e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  40.32 
 
 
365 aa  276  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  40.21 
 
 
387 aa  275  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  40.05 
 
 
365 aa  275  9e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  39.31 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  40.21 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  39.25 
 
 
365 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  39.95 
 
 
365 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  39.95 
 
 
365 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  38.54 
 
 
365 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  39.26 
 
 
377 aa  268  8e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  38.27 
 
 
365 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  39.41 
 
 
365 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  38.99 
 
 
377 aa  267  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  39.36 
 
 
365 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  38.01 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  39.1 
 
 
365 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  38.83 
 
 
365 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  38.67 
 
 
381 aa  262  6e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  38.87 
 
 
365 aa  262  6.999999999999999e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.88 
 
 
1134 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.79 
 
 
1055 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.79 
 
 
1113 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.79 
 
 
1086 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.79 
 
 
1058 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.79 
 
 
1076 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  38.44 
 
 
365 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  36.1 
 
 
1110 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.39 
 
 
414 aa  248  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  36.97 
 
 
417 aa  246  3e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  35.83 
 
 
375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  36.7 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.38 
 
 
413 aa  68.2  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0732  diaminopimelate decarboxylase  22.2 
 
 
443 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  20.79 
 
 
406 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0970  diaminopimelate decarboxylase  21.36 
 
 
421 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1791  diaminopimelate decarboxylase  23.95 
 
 
423 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  24.25 
 
 
451 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  23.34 
 
 
423 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.7 
 
 
388 aa  59.3  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  23.47 
 
 
423 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6013  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  21.72 
 
 
486 aa  57  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.21 
 
 
388 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  27.84 
 
 
416 aa  56.6  0.0000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0523  diaminopimelate decarboxylase  22.93 
 
 
402 aa  56.2  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  23.02 
 
 
394 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  20.99 
 
 
435 aa  55.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  28.35 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0612  diaminopimelate decarboxylase  21.53 
 
 
436 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.239326  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2425  diaminopimelate decarboxylase  24.76 
 
 
461 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.131973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  21.99 
 
 
421 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1405  diaminopimelate decarboxylase  23.79 
 
 
419 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  21.99 
 
 
421 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0382  diaminopimelate decarboxylase  23.17 
 
 
439 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  20.73 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2859  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.4 
 
 
421 aa  53.5  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000208534  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.24 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  21.99 
 
 
430 aa  53.5  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0790  diaminopimelate decarboxylase  23.02 
 
 
385 aa  53.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.867864 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>