231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1129 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 
382 aa  794    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  72.61 
 
 
376 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  64.72 
 
 
379 aa  526  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  59.26 
 
 
378 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  59.27 
 
 
399 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  57.89 
 
 
387 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  54.57 
 
 
391 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  55.73 
 
 
384 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  55.47 
 
 
400 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  54.33 
 
 
390 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  53.95 
 
 
389 aa  441  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  54.99 
 
 
384 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  53.39 
 
 
384 aa  432  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  52.99 
 
 
397 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  52.02 
 
 
405 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  52.44 
 
 
392 aa  424  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  51.75 
 
 
384 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  50.77 
 
 
408 aa  418  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  51.75 
 
 
384 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  50.77 
 
 
385 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  52.91 
 
 
382 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  51.45 
 
 
380 aa  403  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  51.59 
 
 
379 aa  401  1e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  51.58 
 
 
386 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  46.65 
 
 
406 aa  395  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  48.95 
 
 
382 aa  385  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  48.12 
 
 
376 aa  381  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  48.95 
 
 
382 aa  384  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  48.43 
 
 
382 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  50.79 
 
 
380 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  47.57 
 
 
387 aa  372  1e-102  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  47.31 
 
 
375 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.72 
 
 
390 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.89 
 
 
399 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  45.79 
 
 
377 aa  364  1e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  45.72 
 
 
408 aa  353  2e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.73 
 
 
390 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.06 
 
 
390 aa  344  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  43.94 
 
 
400 aa  339  5e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  43.58 
 
 
378 aa  337  1.9999999999999998e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  41.13 
 
 
365 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  40.59 
 
 
365 aa  289  7e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  40.59 
 
 
365 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  40.32 
 
 
365 aa  279  6e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  38.71 
 
 
365 aa  278  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  38.44 
 
 
365 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  38.17 
 
 
365 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  38.17 
 
 
365 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  40.21 
 
 
389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  37.9 
 
 
365 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  39.25 
 
 
365 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  40.36 
 
 
379 aa  268  8.999999999999999e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  39.68 
 
 
365 aa  268  8.999999999999999e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  37.22 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  39.25 
 
 
387 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.97 
 
 
414 aa  264  2e-69  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  38.5 
 
 
377 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  37.2 
 
 
365 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  38.71 
 
 
377 aa  256  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  36.93 
 
 
365 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  36.93 
 
 
365 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  36.02 
 
 
381 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  32.45 
 
 
1055 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  32.45 
 
 
1113 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  32.45 
 
 
1086 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  32.45 
 
 
1058 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  32.45 
 
 
1076 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  36.02 
 
 
376 aa  234  2.0000000000000002e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  32.45 
 
 
1134 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  32.19 
 
 
1110 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  34.49 
 
 
375 aa  223  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  23.38 
 
 
435 aa  70.9  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  25.73 
 
 
417 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  22.98 
 
 
423 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  23.84 
 
 
418 aa  63.5  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.54 
 
 
388 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  26.36 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.49 
 
 
393 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  26.59 
 
 
416 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  22.61 
 
 
415 aa  60.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.07 
 
 
388 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  21.93 
 
 
410 aa  60.1  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  24.31 
 
 
417 aa  59.7  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  25.4 
 
 
414 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  21.39 
 
 
413 aa  59.7  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  24.54 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  23.19 
 
 
435 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  21.39 
 
 
434 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  22.14 
 
 
424 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  20.88 
 
 
407 aa  58.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6013  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  20.62 
 
 
486 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1791  diaminopimelate decarboxylase  19.85 
 
 
423 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1275  diaminopimelate decarboxylase  22 
 
 
386 aa  57.4  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000162613  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  22.89 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  22.35 
 
 
386 aa  57  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  22.34 
 
 
423 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  21.17 
 
 
406 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
445 aa  56.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  25 
 
 
414 aa  56.2  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>