81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1867 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  97.12 
 
 
382 aa  770    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  97.91 
 
 
382 aa  776    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 
382 aa  792    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  76.98 
 
 
387 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  59.17 
 
 
379 aa  471  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  59.95 
 
 
380 aa  472  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  54.62 
 
 
377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  55.23 
 
 
408 aa  436  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  56.07 
 
 
382 aa  431  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  55.26 
 
 
380 aa  421  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  48.43 
 
 
382 aa  380  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  45.71 
 
 
376 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  47.62 
 
 
376 aa  363  3e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  42.86 
 
 
408 aa  359  5e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  44.09 
 
 
378 aa  353  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  44.91 
 
 
379 aa  352  7e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  45.67 
 
 
375 aa  349  5e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  44.85 
 
 
384 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  44.06 
 
 
384 aa  348  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  43.62 
 
 
384 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  44.25 
 
 
399 aa  346  5e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  44.06 
 
 
384 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  44.06 
 
 
400 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  43.6 
 
 
397 aa  338  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  42.16 
 
 
385 aa  335  5.999999999999999e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  43.01 
 
 
384 aa  335  9e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.57 
 
 
387 aa  333  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  42.2 
 
 
392 aa  331  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  42.48 
 
 
386 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  42.25 
 
 
406 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  40.41 
 
 
390 aa  324  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  39.95 
 
 
391 aa  323  3e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  40.05 
 
 
389 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  40.99 
 
 
378 aa  320  3.9999999999999996e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.74 
 
 
399 aa  302  8.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  38.38 
 
 
400 aa  300  3e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.44 
 
 
390 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  37.41 
 
 
405 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.15 
 
 
390 aa  277  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.21 
 
 
390 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  39.04 
 
 
365 aa  272  7e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  37.97 
 
 
365 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  39.36 
 
 
389 aa  262  6e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 
365 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.1 
 
 
414 aa  261  2e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  39.36 
 
 
365 aa  261  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  39.1 
 
 
365 aa  260  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  38.42 
 
 
377 aa  260  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  37.77 
 
 
365 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  37.6 
 
 
365 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  37.6 
 
 
365 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  38.13 
 
 
377 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  37.11 
 
 
387 aa  257  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  36.8 
 
 
365 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  36.27 
 
 
381 aa  256  6e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  37.23 
 
 
365 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  37.33 
 
 
365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  37.87 
 
 
365 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  36.53 
 
 
365 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  38.6 
 
 
417 aa  252  8.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  38.77 
 
 
365 aa  251  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  38.42 
 
 
379 aa  249  5e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  36.07 
 
 
368 aa  249  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  37.11 
 
 
376 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  31.5 
 
 
375 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.49 
 
 
1055 aa  209  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.49 
 
 
1134 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.49 
 
 
1086 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.49 
 
 
1058 aa  209  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.49 
 
 
1113 aa  208  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.49 
 
 
1076 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.23 
 
 
1110 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0584  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.9 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000391397  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  19.85 
 
 
425 aa  51.2  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  19.89 
 
 
394 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1225  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  20.84 
 
 
413 aa  49.3  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  21.39 
 
 
421 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.34 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.34 
 
 
388 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  20.92 
 
 
406 aa  43.1  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  24.06 
 
 
393 aa  42.7  0.01  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>