158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2096 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  82.29 
 
 
400 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 
397 aa  819    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  81.51 
 
 
384 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  78.32 
 
 
392 aa  635    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  82.29 
 
 
384 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  82.55 
 
 
384 aa  673    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  76.3 
 
 
384 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  75.26 
 
 
384 aa  625  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  60.96 
 
 
387 aa  484  1e-135  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  59.68 
 
 
391 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  58.13 
 
 
390 aa  451  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  58.29 
 
 
389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  56.85 
 
 
399 aa  443  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  56.6 
 
 
376 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  57.03 
 
 
378 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  55.64 
 
 
405 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  52.99 
 
 
382 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  52.23 
 
 
379 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  52.67 
 
 
406 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  51.19 
 
 
382 aa  395  1e-109  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  51.68 
 
 
408 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.53 
 
 
390 aa  395  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.92 
 
 
399 aa  394  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  51.08 
 
 
375 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  53.07 
 
 
376 aa  394  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.21 
 
 
390 aa  376  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  47.4 
 
 
380 aa  360  2e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  48.13 
 
 
386 aa  360  3e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  49.6 
 
 
378 aa  358  7e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  46.03 
 
 
385 aa  358  7e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  48.41 
 
 
380 aa  357  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  46.48 
 
 
379 aa  356  5e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  47.49 
 
 
400 aa  349  4e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  43.6 
 
 
382 aa  342  8e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  44.65 
 
 
377 aa  342  8e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  43.6 
 
 
382 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  43.8 
 
 
387 aa  339  5e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  43.6 
 
 
382 aa  338  7e-92  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.87 
 
 
390 aa  332  8e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  42.43 
 
 
408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  40.37 
 
 
365 aa  280  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  39.42 
 
 
365 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  39.84 
 
 
365 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  40.37 
 
 
365 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  40.16 
 
 
368 aa  267  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  41.18 
 
 
365 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  40.11 
 
 
365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  41.18 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  41.18 
 
 
365 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  39.3 
 
 
365 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  39.84 
 
 
365 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  39.3 
 
 
365 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  38.77 
 
 
365 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  38.54 
 
 
381 aa  263  4e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  39.04 
 
 
365 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  39.3 
 
 
389 aa  262  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  38.93 
 
 
377 aa  257  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  38.01 
 
 
387 aa  256  4e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  38.81 
 
 
377 aa  256  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  37.37 
 
 
379 aa  254  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  38.92 
 
 
376 aa  250  3e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.41 
 
 
414 aa  246  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  37.17 
 
 
365 aa  246  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.16 
 
 
417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.34 
 
 
1055 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.34 
 
 
1076 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.34 
 
 
1113 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.34 
 
 
1086 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.34 
 
 
1058 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.34 
 
 
1134 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.26 
 
 
1110 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  34.22 
 
 
375 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  22.73 
 
 
447 aa  71.2  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  25.45 
 
 
394 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  24.48 
 
 
435 aa  60.8  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21592  diaminopimelate decarboxylase  24.1 
 
 
481 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  24.3 
 
 
424 aa  56.6  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1495  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.63 
 
 
401 aa  56.6  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  24.46 
 
 
400 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  23.83 
 
 
437 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  26.09 
 
 
423 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  24.19 
 
 
878 aa  53.1  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  23.88 
 
 
409 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2711  diaminopimelate decarboxylase  22.42 
 
 
465 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757522  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  23.56 
 
 
431 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2602  diaminopimelate decarboxylase  22.42 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  25.6 
 
 
421 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  23.75 
 
 
421 aa  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  23.79 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2502  diaminopimelate decarboxylase  22.42 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.512966  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  25.6 
 
 
421 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2548  diaminopimelate decarboxylase  22.42 
 
 
465 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.72 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  26.21 
 
 
422 aa  52.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2590  diaminopimelate decarboxylase  22.2 
 
 
465 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  0.439356 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  27.71 
 
 
421 aa  50.8  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  23.19 
 
 
440 aa  50.4  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  23.73 
 
 
433 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  21.21 
 
 
430 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  27.56 
 
 
421 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>