90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1082 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 390 aa  808    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  51.26 
 
 		 378 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  48.73 
 
 		 382 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  48.06 
 
 		 387 aa  345  6e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  48.93 
 
 		 399 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  45.38 
 
 		 376 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  47.4 
 
 		 390 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  46.87 
 
 		 397 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  45.73 
 
 		 391 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  44.94 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  46.24 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  45.81 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  47.04 
 
 		 405 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  45.28 
 
 		 400 aa  318  9e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  43.25 
 
 		 385 aa  316  5e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  45 
 
 		 384 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  47.16 
 
 		 380 aa  314  9.999999999999999e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  45.35 
 
 		 384 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  43.84 
 
 		 375 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  44.1 
 
 		 380 aa  309  5e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  44.77 
 
 		 384 aa  306  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  44.7 
 
 		 384 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  42.82 
 
 		 379 aa  305  9.000000000000001e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  42.57 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  44.26 
 
 		 392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  44.66 
 
 		 376 aa  303  5.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  43.98 
 
 		 382 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  44.39 
 
 		 406 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  41.32 
 
 		 408 aa  297  2e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  38.66 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  41.22 
 
 		 400 aa  283  5.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  42.11 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  42.15 
 
 		 382 aa  277  2e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  41.83 
 
 		 382 aa  276  5e-73  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.11 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  40.39 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.62 
 
 		 399 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  40.4 
 
 		 378 aa  266  5.999999999999999e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  36.06 
 
 		 408 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.33 
 
 		 390 aa  256  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  36.39 
 
 		 381 aa  232  7.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  36.93 
 
 		 365 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  36.93 
 
 		 365 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  36.36 
 
 		 365 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  37.05 
 
 		 379 aa  230  3e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  36.65 
 
 		 365 aa  230  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  36.65 
 
 		 365 aa  229  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  36.57 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  36.08 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  36.65 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  36.36 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  36.39 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  35.8 
 
 		 389 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  35.8 
 
 		 365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  35.71 
 
 		 387 aa  223  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  34.94 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.74 
 
 		 414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  36.75 
 
 		 376 aa  216  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  36.47 
 
 		 365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.47 
 
 		 417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  36.18 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  36.18 
 
 		 365 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  35.31 
 
 		 368 aa  209  5e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  35.04 
 
 		 365 aa  208  1e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.25 
 
 		 1086 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.25 
 
 		 1113 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.25 
 
 		 1058 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.25 
 
 		 1055 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.25 
 
 		 1134 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  34.25 
 
 		 1076 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  33.98 
 
 		 1110 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  33.99 
 
 		 375 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21592  diaminopimelate decarboxylase  26.02 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28310  Diaminopimelate decarboxylase  24.04 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0114023  hitchhiker  0.00277036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  24.11 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  23.9 
 
 		 421 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  25.65 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  26.57 
 
 		 421 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  25.49 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  27.14 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  26.23 
 
 		 417 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  24.71 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1157  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.14 
 
 		 376 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2740  diaminopimelate decarboxylase  23.04 
 
 		 411 aa  44.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  23.01 
 
 		 859 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4876  diaminopimelate decarboxylase  23.33 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000066198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  28.78 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 		 417 aa  43.1  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1774  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  23.01 
 
 		 859 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>