96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1230 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  84.88 
 
 		 377 aa  689    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  81.55 
 
 		 381 aa  660    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  84.08 
 
 		 377 aa  685    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 387 aa  803    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  69.38 
 
 		 376 aa  542  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  53.13 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  50.95 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  50.68 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  50.95 
 
 		 365 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  50.95 
 
 		 365 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  50.41 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  51.91 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  49.32 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  51.23 
 
 		 365 aa  372  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  51.91 
 
 		 365 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  50.95 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  51.91 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  50.95 
 
 		 365 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  49.19 
 
 		 368 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  50.95 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  46.32 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  47.88 
 
 		 379 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.97 
 
 		 414 aa  335  5.999999999999999e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  44.72 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  40.79 
 
 		 382 aa  281  1e-74  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  40.21 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  37.9 
 
 		 378 aa  275  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  38.1 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  39.35 
 
 		 384 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  39.35 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  41.29 
 
 		 376 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  41.3 
 
 		 380 aa  265  8.999999999999999e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  39.25 
 
 		 382 aa  264  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  37.4 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  37.63 
 
 		 382 aa  262  6e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  37.87 
 
 		 390 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  37.37 
 
 		 382 aa  260  4e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  37.56 
 
 		 408 aa  259  5.0000000000000005e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  37.88 
 
 		 399 aa  258  9e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  36.55 
 
 		 387 aa  258  1e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  37.3 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  37.11 
 
 		 382 aa  257  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  38.01 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  36.51 
 
 		 377 aa  255  7e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  37 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  36.15 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  36.39 
 
 		 400 aa  250  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  35.98 
 
 		 389 aa  249  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  37.2 
 
 		 384 aa  249  6e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  36.66 
 
 		 384 aa  247  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  36.39 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  36.15 
 
 		 392 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.63 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  35.01 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  36.1 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  33.5 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  35.53 
 
 		 385 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  33.5 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 408 aa  223  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.71 
 
 		 390 aa  223  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  35.29 
 
 		 378 aa  221  9.999999999999999e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 1110 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 1086 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 1055 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 1058 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 1113 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 1076 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 		 1134 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.32 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.16 
 
 		 399 aa  212  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.78 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  29.3 
 
 		 375 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  21.38 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4745  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.19 
 
 		 582 aa  55.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  23.83 
 
 		 416 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  21.59 
 
 		 435 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  23.13 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  23.24 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  24.8 
 
 		 445 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  21.31 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  25.62 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  22.67 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  23.24 
 
 		 406 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  20.92 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1814  diaminopimelate decarboxylase  21.84 
 
 		 426 aa  47  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.040954  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  23.14 
 
 		 422 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  20.92 
 
 		 402 aa  47  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  24.68 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0541  diaminopimelate decarboxylase  22.26 
 
 		 421 aa  45.8  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.407931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  23.93 
 
 		 422 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  20 
 
 		 447 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  25.36 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0425  diaminopimelate decarboxylase  21.88 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  25.45 
 
 		 427 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  19.93 
 
 		 394 aa  43.1  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  26.19 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>