113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0118 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 
408 aa  842    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  63.79 
 
 
379 aa  528  1e-149  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  63.05 
 
 
380 aa  524  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  60.54 
 
 
377 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  54.57 
 
 
382 aa  435  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  55.23 
 
 
382 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  54.99 
 
 
382 aa  434  1e-120  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  54.74 
 
 
387 aa  431  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  53.41 
 
 
382 aa  420  1e-116  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  53.81 
 
 
380 aa  419  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  45.04 
 
 
376 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  42.45 
 
 
408 aa  361  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  45.72 
 
 
382 aa  353  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  43.03 
 
 
399 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  43.28 
 
 
378 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  41.81 
 
 
379 aa  334  1e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.27 
 
 
387 aa  328  9e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  40.69 
 
 
386 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  40 
 
 
391 aa  326  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  39.76 
 
 
385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  42.18 
 
 
384 aa  319  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  41.09 
 
 
375 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  42.93 
 
 
384 aa  316  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  42.68 
 
 
400 aa  316  5e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  42.18 
 
 
384 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  42.18 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  41.48 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  41.94 
 
 
384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  39.13 
 
 
390 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  42.43 
 
 
397 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  40.49 
 
 
376 aa  309  5e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  39.29 
 
 
405 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  38.44 
 
 
389 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  37.74 
 
 
406 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  37.93 
 
 
378 aa  293  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.46 
 
 
399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  37.88 
 
 
400 aa  284  2.0000000000000002e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.44 
 
 
390 aa  280  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.14 
 
 
390 aa  266  5.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.06 
 
 
390 aa  263  4.999999999999999e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 
379 aa  242  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  35.89 
 
 
368 aa  242  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  36.91 
 
 
365 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  36.66 
 
 
365 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  36.48 
 
 
365 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  35.07 
 
 
365 aa  230  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  36.16 
 
 
389 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  35.29 
 
 
377 aa  228  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  34.83 
 
 
365 aa  227  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  37 
 
 
365 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  35.5 
 
 
365 aa  223  3e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  35.05 
 
 
377 aa  224  3e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  35.75 
 
 
365 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 
387 aa  223  4e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  35.75 
 
 
365 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  35.5 
 
 
365 aa  223  6e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  35.75 
 
 
365 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  33.33 
 
 
381 aa  222  9e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  36 
 
 
365 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  35.75 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.82 
 
 
414 aa  219  7.999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.05 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  34.41 
 
 
365 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.1 
 
 
1113 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.1 
 
 
1055 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.1 
 
 
1058 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.1 
 
 
1086 aa  206  6e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.1 
 
 
1076 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.17 
 
 
1110 aa  206  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.1 
 
 
1134 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  32.02 
 
 
375 aa  199  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  31.54 
 
 
376 aa  196  6e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  24.15 
 
 
434 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21592  diaminopimelate decarboxylase  27.96 
 
 
481 aa  56.6  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02010  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  24.9 
 
 
850 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  23.64 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  23.47 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  23.47 
 
 
420 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  23.15 
 
 
420 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  23.36 
 
 
420 aa  50.4  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  23.1 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  23.1 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  23.1 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  23.1 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  23.1 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  23.74 
 
 
412 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.08 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627883  normal  0.114267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  23.99 
 
 
420 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  23.57 
 
 
421 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0407  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  21.26 
 
 
857 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  23.99 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3181  diaminopimelate decarboxylase  23.99 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  23.99 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  23.65 
 
 
420 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  23.57 
 
 
447 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3625  diaminopimelate decarboxylase  23.7 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1775  bifunctional aspartate kinase/diaminopimelate decarboxylase protein  22.07 
 
 
859 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  21.58 
 
 
420 aa  46.2  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  21.94 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  22.43 
 
 
410 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.220702 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>