88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02739 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  97.08 
 
 		 377 aa  766    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  80.05 
 
 		 381 aa  648    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  100 
 
 		 377 aa  783    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  84.08 
 
 		 387 aa  685    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  70.51 
 
 		 376 aa  552  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  50.68 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  52.43 
 
 		 389 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  51.36 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  50.68 
 
 		 365 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  52.17 
 
 		 365 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  51.9 
 
 		 365 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  50.14 
 
 		 365 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  51.09 
 
 		 365 aa  364  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  49.59 
 
 		 368 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  50.14 
 
 		 365 aa  364  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  49.86 
 
 		 365 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  49.32 
 
 		 365 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  49.73 
 
 		 365 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  49.73 
 
 		 365 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  48.63 
 
 		 365 aa  349  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  46.87 
 
 		 365 aa  342  7e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  48.55 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.98 
 
 		 414 aa  333  2e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  45.98 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  39.14 
 
 		 379 aa  269  5e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  38.99 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  38.95 
 
 		 382 aa  266  5.999999999999999e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  38.14 
 
 		 408 aa  262  6.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  38.42 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  38.68 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  38.93 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  38.01 
 
 		 384 aa  257  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  38.27 
 
 		 384 aa  256  3e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  38.5 
 
 		 382 aa  256  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  36.19 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  37.53 
 
 		 382 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  37.37 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  36.91 
 
 		 390 aa  252  6e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  39.95 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  38.87 
 
 		 376 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  36.8 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  36.73 
 
 		 379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  34.83 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  36.8 
 
 		 384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  37.56 
 
 		 399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  36.24 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  35.88 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  36.93 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  35.85 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  36.12 
 
 		 384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  36.03 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  33.5 
 
 		 405 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  33.68 
 
 		 391 aa  228  9e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.57 
 
 		 390 aa  228  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.28 
 
 		 387 aa  226  7e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  35.05 
 
 		 408 aa  224  3e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  33.08 
 
 		 406 aa  223  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  34.91 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  33.17 
 
 		 400 aa  218  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  35.39 
 
 		 386 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.4 
 
 		 390 aa  216  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  34.58 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.33 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.48 
 
 		 1113 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.48 
 
 		 1086 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.48 
 
 		 1058 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.48 
 
 		 1076 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.48 
 
 		 1055 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.59 
 
 		 399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  29.95 
 
 		 1110 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  30.48 
 
 		 1134 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  29.68 
 
 		 375 aa  182  6e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4745  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.19 
 
 		 582 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0440633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  21.35 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  25.25 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21592  diaminopimelate decarboxylase  22.97 
 
 		 481 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  20.43 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  24.74 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  20.94 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  23.66 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  24.81 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  29.2 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  18.47 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  20.94 
 
 		 402 aa  44.7  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  26.5 
 
 		 423 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  22.28 
 
 		 416 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  19.83 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0279  diaminopimelate decarboxylase  21.11 
 
 		 451 aa  42.7  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>