247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0982 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  82.81 
 
 		 384 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  85.94 
 
 		 400 aa  691    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 384 aa  788    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  84.11 
 
 		 384 aa  689    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  82.29 
 
 		 397 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  86.2 
 
 		 384 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  81.89 
 
 		 392 aa  662    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  83.59 
 
 		 384 aa  676    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  60.21 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  58.56 
 
 		 387 aa  471  1e-132  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  58.56 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  57.33 
 
 		 390 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  57.07 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  58.65 
 
 		 378 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  57.14 
 
 		 376 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  53.39 
 
 		 382 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  54.36 
 
 		 405 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  52.08 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  51.91 
 
 		 406 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  52.97 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  49.87 
 
 		 382 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  51.45 
 
 		 399 aa  392  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.79 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  52.42 
 
 		 376 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  49.73 
 
 		 375 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.26 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  47.88 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  48.68 
 
 		 380 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  46.48 
 
 		 379 aa  362  9e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  46.67 
 
 		 386 aa  356  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  45.83 
 
 		 380 aa  355  5e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  45.38 
 
 		 387 aa  353  2e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  44.33 
 
 		 382 aa  351  1e-95  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  43.6 
 
 		 382 aa  349  5e-95  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  48.24 
 
 		 400 aa  349  6e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  44.06 
 
 		 382 aa  348  8e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  45.58 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  42.78 
 
 		 377 aa  332  6e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  41.94 
 
 		 408 aa  313  2.9999999999999996e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.7 
 
 		 390 aa  306  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  39.04 
 
 		 365 aa  276  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  39.3 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  39.04 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  38.77 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  38.77 
 
 		 365 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  39.04 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  38.24 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  39.57 
 
 		 365 aa  265  8e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  39.3 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  39.3 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  39.73 
 
 		 365 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  38.77 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  39.46 
 
 		 365 aa  259  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  39.46 
 
 		 365 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  38.24 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  38.22 
 
 		 379 aa  253  4.0000000000000004e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  36.66 
 
 		 381 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  36.39 
 
 		 387 aa  246  6e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  37.2 
 
 		 377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  36.36 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  36.8 
 
 		 377 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.9 
 
 		 414 aa  242  9e-63  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  36.36 
 
 		 376 aa  241  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.41 
 
 		 417 aa  238  1e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.6 
 
 		 1055 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.6 
 
 		 1058 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.6 
 
 		 1113 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.6 
 
 		 1076 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.6 
 
 		 1086 aa  227  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.6 
 
 		 1134 aa  226  4e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.53 
 
 		 1110 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  34.93 
 
 		 375 aa  195  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  24.47 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  23.95 
 
 		 418 aa  66.2  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  27.33 
 
 		 418 aa  64.7  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  24.74 
 
 		 431 aa  63.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  24.17 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1656  aspartate kinase  24.93 
 
 		 878 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  25.07 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  24.46 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  25.99 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  23.73 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  25.99 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  25.99 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2548  diaminopimelate decarboxylase  23.97 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2711  diaminopimelate decarboxylase  23.97 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2602  diaminopimelate decarboxylase  23.97 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2502  diaminopimelate decarboxylase  23.97 
 
 		 465 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.512966  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  21.71 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0160  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.22 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2590  diaminopimelate decarboxylase  23.74 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  0.439356 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  23.86 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  26.15 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  27.31 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  23.24 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  24.87 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  23.32 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  23.9 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  27.11 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  27.56 
 
 		 422 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>