More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_0160 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_0160  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 434 aa  880    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  25.59 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  27.58 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  27.7 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  28.14 
 
 		 420 aa  125  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  24.01 
 
 		 422 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  24.06 
 
 		 416 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0477  diaminopimelate decarboxylase  26.52 
 
 		 430 aa  120  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  23.97 
 
 		 451 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  27.8 
 
 		 436 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  26.04 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0199  diaminopimelate decarboxylase  26.88 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258223 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  24.4 
 
 		 416 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  23.75 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  27.56 
 
 		 436 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  27.41 
 
 		 418 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  25.33 
 
 		 418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  22.89 
 
 		 420 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  24.8 
 
 		 421 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  25.68 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  22.93 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  25.29 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  25.29 
 
 		 421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  24.72 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  23.48 
 
 		 422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  23.41 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  26.74 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1329  diaminopimelate decarboxylase  24.33 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1510  diaminopimelate decarboxylase  24.33 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000156168 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1438  diaminopimelate decarboxylase  24.33 
 
 		 438 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  26.79 
 
 		 401 aa  113  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  23.67 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1141  diaminopimelate decarboxylase  24.15 
 
 		 438 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1473  diaminopimelate decarboxylase  24.49 
 
 		 438 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 		 436 aa  112  9e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  28.12 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2332  diaminopimelate decarboxylase  24.58 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.247782  normal  0.140029 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  22.44 
 
 		 423 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1303  diaminopimelate decarboxylase  24.09 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2590  diaminopimelate decarboxylase  22.79 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  0.439356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1579  diaminopimelate decarboxylase  24.33 
 
 		 438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111116  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2548  diaminopimelate decarboxylase  22.79 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2602  diaminopimelate decarboxylase  22.79 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2502  diaminopimelate decarboxylase  22.79 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.512966  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  26.08 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2711  diaminopimelate decarboxylase  22.79 
 
 		 465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757522  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1542  diaminopimelate decarboxylase  24.33 
 
 		 438 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  24.04 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  25.38 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  25.58 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  24.04 
 
 		 421 aa  111  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  24.71 
 
 		 417 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  25.08 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1302  diaminopimelate decarboxylase  24.09 
 
 		 438 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  25.41 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  24.27 
 
 		 421 aa  110  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  24.8 
 
 		 415 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  23.82 
 
 		 425 aa  110  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  24.76 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  24.76 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0970  diaminopimelate decarboxylase  23.7 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  23.87 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  27.08 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1342  diaminopimelate decarboxylase  24.17 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.369143  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3871  diaminopimelate decarboxylase  23.98 
 
 		 438 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.063243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  24.82 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  24.93 
 
 		 415 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  23.45 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  23.75 
 
 		 423 aa  108  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  23.82 
 
 		 417 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  26.72 
 
 		 435 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  25.64 
 
 		 429 aa  107  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  24.87 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  27.05 
 
 		 417 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  27.43 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  27.05 
 
 		 414 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  24.6 
 
 		 421 aa  107  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  24.4 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.79 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  23.14 
 
 		 430 aa  107  6e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  26.3 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  28.2 
 
 		 407 aa  106  8e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3606  diaminopimelate decarboxylase  22.14 
 
 		 420 aa  106  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00198954  hitchhiker  0.0000000450016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  25.96 
 
 		 417 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  23.39 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  22.83 
 
 		 422 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  24.69 
 
 		 417 aa  106  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  25.21 
 
 		 416 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  25.07 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  25.32 
 
 		 437 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  22.95 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  25.26 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3377  diaminopimelate decarboxylase  25.85 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411773  normal  0.115373 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  25.27 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  24.07 
 
 		 421 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  25.73 
 
 		 415 aa  104  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  25.3 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  26.88 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  23.51 
 
 		 433 aa  103  8e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  23.36 
 
 		 422 aa  103  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>