More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0113 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0113  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 442 aa  900    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0528354  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0098  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  74.1 
 
 		 440 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0486  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.66 
 
 		 417 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252649  normal  0.657753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.1 
 
 		 416 aa  317  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44 
 
 		 508 aa  296  5e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00597643  normal  0.0295865 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3620  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.06 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0244678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2528  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  39.85 
 
 		 416 aa  266  7e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0397628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2669  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  39.59 
 
 		 410 aa  257  3e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.499942  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1392  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  38.99 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0214918  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3734  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.02 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2435  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.82 
 
 		 412 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0700  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.38 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3425  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.57 
 
 		 431 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  0.792047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3805  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.4 
 
 		 404 aa  249  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0136  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  38.64 
 
 		 402 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0421  putative Orn/DAP/Arg decarboxylase  38.82 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1957  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.29 
 
 		 410 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.47769  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4274  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  37.91 
 
 		 402 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282467 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1565  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.28 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3255  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.96 
 
 		 415 aa  242  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2019  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.91 
 
 		 419 aa  237  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.225254 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0126  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.24 
 
 		 411 aa  238  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1290  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.79 
 
 		 414 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7006  pyridoxal-dependent decarboxylase, exosortase system type 1 associated  39.39 
 
 		 408 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1835  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.18 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.59311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3058  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.54 
 
 		 418 aa  216  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.700588  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2078  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.73 
 
 		 428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1929  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.73 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  32.85 
 
 		 414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  32.05 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  32.54 
 
 		 414 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  31.81 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  31.57 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4030  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.51 
 
 		 413 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.157056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  33.49 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  32.6 
 
 		 414 aa  193  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  32.27 
 
 		 418 aa  193  6e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  33.09 
 
 		 415 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2337  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.44 
 
 		 408 aa  192  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  31.94 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  28.88 
 
 		 420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  32.85 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  32.26 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  31.57 
 
 		 414 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  31.89 
 
 		 422 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  32.85 
 
 		 415 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  31.95 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  32.3 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3112  diaminopimelate decarboxylase  32.92 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.507719  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  32.45 
 
 		 419 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  31.63 
 
 		 423 aa  188  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  27.94 
 
 		 419 aa  187  3e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  31.63 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  29.58 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  30.29 
 
 		 435 aa  186  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1199  diaminopimelate decarboxylase  32.45 
 
 		 418 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0292186  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  30.22 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  31.41 
 
 		 414 aa  183  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  32.12 
 
 		 415 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  31.18 
 
 		 424 aa  182  9.000000000000001e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  32.85 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  32.78 
 
 		 425 aa  182  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  31.71 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  31.16 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  31.34 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  30.94 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0245  diaminopimelate decarboxylase  32.6 
 
 		 415 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.377243  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  31.04 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 		 421 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  31.81 
 
 		 414 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  31.01 
 
 		 420 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  31.81 
 
 		 414 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  31.81 
 
 		 414 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  32.12 
 
 		 419 aa  179  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  30.68 
 
 		 416 aa  179  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  29.95 
 
 		 418 aa  179  9e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  29.74 
 
 		 415 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  31.57 
 
 		 414 aa  179  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  31.52 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  30.84 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  31.28 
 
 		 427 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1016  non-ribosomal peptide synthetase module-containing protein  41.18 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  31.64 
 
 		 419 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  30.59 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  31.28 
 
 		 427 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  33.17 
 
 		 423 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  30.55 
 
 		 417 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  30.2 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  32.43 
 
 		 415 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  32.06 
 
 		 423 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  30.83 
 
 		 415 aa  176  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  31.57 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  29.88 
 
 		 420 aa  176  6e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  30.71 
 
 		 416 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  31.41 
 
 		 414 aa  176  6e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3606  diaminopimelate decarboxylase  31.74 
 
 		 420 aa  176  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00198954  hitchhiker  0.0000000450016 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  28.77 
 
 		 429 aa  176  8e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  31.58 
 
 		 423 aa  176  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  30.66 
 
 		 415 aa  176  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>