More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2602 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B2502  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 465 aa  971    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.512966  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2590  diaminopimelate decarboxylase  99.78 
 
 		 465 aa  970    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.851696  normal  0.439356 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2711  diaminopimelate decarboxylase  99.78 
 
 		 465 aa  971    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2602  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 465 aa  971    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2548  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 465 aa  971    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  29.27 
 
 		 447 aa  210  5e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  31.24 
 
 		 433 aa  208  2e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  31.17 
 
 		 430 aa  206  7e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  31.13 
 
 		 416 aa  196  7e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0406  diaminopimelate decarboxylase  31.53 
 
 		 445 aa  196  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  29.77 
 
 		 430 aa  195  1e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0207  diaminopimelate decarboxylase  31.29 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.235177  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0720  diaminopimelate decarboxylase  29.73 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00473762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  29.55 
 
 		 429 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  29.36 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  30.32 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  27.58 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  29.66 
 
 		 418 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  30.49 
 
 		 421 aa  180  5.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  28.02 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0515  diaminopimelate decarboxylase  28.01 
 
 		 436 aa  177  5e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.843079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  30.16 
 
 		 448 aa  176  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  29.49 
 
 		 425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2242  diaminopimelate decarboxylase  29.17 
 
 		 439 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0241935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  29 
 
 		 423 aa  173  6.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  29.02 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  30.63 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  30.67 
 
 		 421 aa  172  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  29.73 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  30.67 
 
 		 421 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  28.31 
 
 		 412 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  27.4 
 
 		 417 aa  171  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  30.2 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  27.42 
 
 		 415 aa  170  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1348  diaminopimelate decarboxylase  28.82 
 
 		 416 aa  170  6e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000478718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  29.1 
 
 		 401 aa  169  7e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  28.51 
 
 		 418 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  29.4 
 
 		 416 aa  169  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  28.25 
 
 		 416 aa  169  9e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1422  diaminopimelate decarboxylase  27.31 
 
 		 441 aa  169  9e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000179827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  28.02 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0693  diaminopimelate decarboxylase  29.77 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0357164  unclonable  3.07983e-19 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  28.99 
 
 		 424 aa  169  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  28.76 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  29.33 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  27.83 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  28.08 
 
 		 423 aa  167  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  27.25 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  28.23 
 
 		 436 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1473  diaminopimelate decarboxylase  28.94 
 
 		 436 aa  166  9e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  27.39 
 
 		 427 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  29.17 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  29.05 
 
 		 422 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  29.67 
 
 		 403 aa  166  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  27.79 
 
 		 451 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  30.5 
 
 		 415 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  28.6 
 
 		 417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1553  diaminopimelate decarboxylase  29.08 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144272  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  28.08 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  28.02 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  29.56 
 
 		 412 aa  164  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3656  diaminopimelate decarboxylase  28.47 
 
 		 457 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  28.32 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  28.28 
 
 		 399 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  29.82 
 
 		 437 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  29.16 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1648  diaminopimelate decarboxylase  27.8 
 
 		 417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00420158  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  30.32 
 
 		 415 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  28.38 
 
 		 431 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0771  diaminopimelate decarboxylase  29.05 
 
 		 427 aa  163  5.0000000000000005e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.129495  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  30.28 
 
 		 415 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  30.28 
 
 		 415 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  26.56 
 
 		 417 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  26.41 
 
 		 420 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  25.16 
 
 		 438 aa  162  8.000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0777  diaminopimelate decarboxylase  26.21 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  26.36 
 
 		 419 aa  163  8.000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  28.76 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 417 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1204  diaminopimelate decarboxylase  28.98 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.313013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  28.41 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  28.7 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  26.97 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  28.54 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  28.18 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  27.93 
 
 		 417 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  27.91 
 
 		 431 aa  161  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  29.25 
 
 		 415 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 		 414 aa  160  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  28.35 
 
 		 421 aa  160  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  29.32 
 
 		 414 aa  160  7e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  28.18 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  26.53 
 
 		 434 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4848  diaminopimelate decarboxylase  28.51 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3276  diaminopimelate decarboxylase  28.96 
 
 		 419 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  27.84 
 
 		 430 aa  159  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  27.77 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  28.15 
 
 		 423 aa  159  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  27.54 
 
 		 421 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>