224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1596 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  100 
 
 		 387 aa  813    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  62.83 
 
 		 384 aa  502  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  61.5 
 
 		 400 aa  498  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  60.96 
 
 		 384 aa  494  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  60.53 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  60.96 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  59.21 
 
 		 384 aa  477  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  58.64 
 
 		 392 aa  475  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  58.56 
 
 		 384 aa  471  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  57.89 
 
 		 382 aa  468  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  56.54 
 
 		 378 aa  454  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  55.91 
 
 		 376 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  53.63 
 
 		 391 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  56.58 
 
 		 390 aa  441  1e-123  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  55.47 
 
 		 399 aa  438  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  54.79 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  52.47 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.4 
 
 		 399 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  52.37 
 
 		 379 aa  425  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  51.42 
 
 		 389 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  52.88 
 
 		 382 aa  410  1e-113  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  50.74 
 
 		 406 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  51.32 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  48.74 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  51.06 
 
 		 386 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  51.32 
 
 		 376 aa  392  1e-108  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  48.2 
 
 		 385 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  49.48 
 
 		 380 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  50 
 
 		 375 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  47.76 
 
 		 379 aa  375  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  47.89 
 
 		 380 aa  376  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  44.27 
 
 		 377 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.06 
 
 		 390 aa  345  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  45.09 
 
 		 400 aa  343  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  44.68 
 
 		 382 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  44.53 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  45.57 
 
 		 382 aa  333  4e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  43.65 
 
 		 387 aa  331  1e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  42.27 
 
 		 408 aa  328  8e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  42.59 
 
 		 378 aa  318  9e-86  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  41.76 
 
 		 365 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  42.29 
 
 		 365 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  42.29 
 
 		 365 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  41.53 
 
 		 365 aa  299  7e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  41.27 
 
 		 365 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  42.02 
 
 		 365 aa  297  3e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  41.22 
 
 		 365 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  42.18 
 
 		 365 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  41.27 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  40.43 
 
 		 365 aa  290  3e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  41.97 
 
 		 379 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  40.16 
 
 		 365 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  38.79 
 
 		 368 aa  268  2e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.04 
 
 		 414 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  39.2 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  39.2 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  37.1 
 
 		 417 aa  261  2e-68  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  39.2 
 
 		 365 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  37.77 
 
 		 365 aa  250  4e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  36.63 
 
 		 387 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  35.43 
 
 		 381 aa  240  4e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  35.6 
 
 		 375 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  35.28 
 
 		 377 aa  226  7e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  34.84 
 
 		 376 aa  225  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  35.45 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.62 
 
 		 1055 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.62 
 
 		 1058 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.62 
 
 		 1086 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.62 
 
 		 1134 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.62 
 
 		 1076 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.62 
 
 		 1113 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.62 
 
 		 1110 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  24.93 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.13 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  23.79 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  23.99 
 
 		 414 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  23.22 
 
 		 417 aa  60.1  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  23.92 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  24.01 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  24.66 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  24.66 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  22.69 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  23.85 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  23.59 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  25.12 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  24.38 
 
 		 417 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  24.4 
 
 		 415 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  23.78 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  22.36 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  21.18 
 
 		 417 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  25.73 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  23.99 
 
 		 421 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  22.96 
 
 		 400 aa  54.3  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  23.76 
 
 		 412 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  24.11 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3440  diaminopimelate decarboxylase  22.72 
 
 		 427 aa  54.3  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  23.6 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  25.72 
 
 		 414 aa  53.1  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  29.63 
 
 		 421 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6013  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.87 
 
 		 486 aa  53.1  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>