232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3051 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 379 aa  781    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  63.3 
 
 		 376 aa  528  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  64.72 
 
 		 382 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  54.79 
 
 		 378 aa  444  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  52.33 
 
 		 391 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  52.37 
 
 		 387 aa  425  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  51.96 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  53.37 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  52.34 
 
 		 384 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  53.1 
 
 		 384 aa  418  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  53.02 
 
 		 400 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  53.12 
 
 		 384 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  50.52 
 
 		 390 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  48.37 
 
 		 405 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  52.23 
 
 		 397 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  51.83 
 
 		 389 aa  410  1e-113  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  52.08 
 
 		 384 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  51.46 
 
 		 386 aa  399  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  50.13 
 
 		 385 aa  399  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  48.47 
 
 		 408 aa  395  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  49.23 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  49.74 
 
 		 380 aa  394  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  50 
 
 		 382 aa  388  1e-106  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  52.39 
 
 		 380 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  48.3 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  46.62 
 
 		 406 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  48.13 
 
 		 376 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  47.04 
 
 		 375 aa  363  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  44.74 
 
 		 377 aa  358  6e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  44.91 
 
 		 382 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.06 
 
 		 390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  44.91 
 
 		 382 aa  356  5e-97  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.96 
 
 		 399 aa  352  5e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  44.91 
 
 		 382 aa  352  7e-96  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  44.08 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.31 
 
 		 390 aa  350  3e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  44.03 
 
 		 378 aa  343  2e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  43.19 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  41.81 
 
 		 408 aa  334  1e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.94 
 
 		 390 aa  325  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  39.68 
 
 		 365 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  39.68 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  39.68 
 
 		 365 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  39.14 
 
 		 365 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  40.11 
 
 		 365 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  39.84 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  37.37 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  37 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  39.3 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 		 1055 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 		 1058 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 		 1113 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 		 1086 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 		 1134 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 		 1110 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  35.56 
 
 		 1076 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  37.63 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  37.53 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  36.73 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  36.36 
 
 		 377 aa  246  6e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  36.1 
 
 		 381 aa  246  6e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  37.63 
 
 		 365 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  35.58 
 
 		 365 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  36.27 
 
 		 368 aa  242  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  37.47 
 
 		 379 aa  242  7.999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  37.27 
 
 		 365 aa  241  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  34.77 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  34.77 
 
 		 365 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.66 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  33.17 
 
 		 414 aa  227  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  36.1 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  36.56 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  23.21 
 
 		 437 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  21.97 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  23.51 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0494  diaminopimelate decarboxylase  23.67 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  24.6 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  22.56 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  23.8 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  24.6 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  21.93 
 
 		 429 aa  56.6  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  22.64 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  27.53 
 
 		 416 aa  55.8  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1791  diaminopimelate decarboxylase  24 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.86 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  25.29 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2511  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  22.3 
 
 		 416 aa  55.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6013  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  21.74 
 
 		 486 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  33.62 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0612  diaminopimelate decarboxylase  21.73 
 
 		 436 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.239326  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2188  diaminopimelate decarboxylase  23.76 
 
 		 382 aa  53.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  22.86 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  33.62 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  23.08 
 
 		 445 aa  53.5  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  24.74 
 
 		 432 aa  53.5  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  25.63 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  24.44 
 
 		 417 aa  53.1  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0976  diaminopimelate decarboxylase  24.38 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.351187  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  34.21 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  24.31 
 
 		 420 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>