More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6013 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6013  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 486 aa  981    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  31.4 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1983  diaminopimelate decarboxylase  31.73 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1908  diaminopimelate decarboxylase  31.73 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  31.15 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  31.96 
 
 		 421 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  30.92 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3860  diaminopimelate decarboxylase  28.06 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0818449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3567  diaminopimelate decarboxylase  28.06 
 
 		 422 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67276  normal  0.379648 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0050  diaminopimelate decarboxylase  29.52 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4020  diaminopimelate decarboxylase  29.06 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  30.12 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1682  diaminopimelate decarboxylase  29.73 
 
 		 430 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4848  diaminopimelate decarboxylase  30.1 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0946328 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0938  diaminopimelate decarboxylase  30.14 
 
 		 421 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0829  diaminopimelate decarboxylase  30.04 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  30.48 
 
 		 421 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  26.05 
 
 		 420 aa  124  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1721  diaminopimelate decarboxylase  38.5 
 
 		 422 aa  123  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0534  diaminopimelate decarboxylase  27.44 
 
 		 434 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2538  diaminopimelate decarboxylase  28.65 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0787755  normal  0.617657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0790  diaminopimelate decarboxylase  26.86 
 
 		 433 aa  121  3e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000940034  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1787  diaminopimelate decarboxylase  29.38 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.16455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  30.1 
 
 		 421 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0510  diaminopimelate decarboxylase  28.91 
 
 		 434 aa  120  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  31.32 
 
 		 421 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  27.66 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1740  diaminopimelate decarboxylase  28.68 
 
 		 422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.309969  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07140  diaminopimelate decarboxylase  28.07 
 
 		 448 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.993125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3040  diaminopimelate decarboxylase  29.47 
 
 		 421 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365095  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11961  diaminopimelate decarboxylase  24.64 
 
 		 457 aa  118  3e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0576  diaminopimelate decarboxylase  26.74 
 
 		 431 aa  117  5e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.757685  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0683  diaminopimelate decarboxylase  26.12 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000143238  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0262  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  26.38 
 
 		 420 aa  116  1.0000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0562  diaminopimelate decarboxylase  26.34 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  26.81 
 
 		 414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1916  diaminopimelate decarboxylase  26.17 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  27.76 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2123  diaminopimelate decarboxylase  37.09 
 
 		 422 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.520792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1042  diaminopimelate decarboxylase  27.36 
 
 		 445 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000128402  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  27.46 
 
 		 414 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1303  diaminopimelate decarboxylase  27.89 
 
 		 435 aa  114  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  24.34 
 
 		 412 aa  114  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  27.23 
 
 		 414 aa  114  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  27.46 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0634  diaminopimelate decarboxylase  25.47 
 
 		 433 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3415  diaminopimelate decarboxylase  29.4 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.656066  normal  0.0355245 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  35.71 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  35.71 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  28.68 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1365  diaminopimelate decarboxylase  23.15 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00386973  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0732  diaminopimelate decarboxylase  29.64 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  35.85 
 
 		 421 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  29.01 
 
 		 421 aa  111  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0056  diaminopimelate decarboxylase  30.05 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  26.68 
 
 		 418 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  27.33 
 
 		 414 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  28.94 
 
 		 421 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0447  diaminopimelate decarboxylase  23.56 
 
 		 436 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4044  diaminopimelate decarboxylase  31.45 
 
 		 422 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.181053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  30.96 
 
 		 431 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  28.68 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1101  diaminopimelate decarboxylase  23.67 
 
 		 457 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  29.44 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  26.76 
 
 		 419 aa  109  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1034  diaminopimelate decarboxylase  27.57 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2097  diaminopimelate decarboxylase  27.6 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2425  diaminopimelate decarboxylase  29.4 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.131973  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1109  diaminopimelate decarboxylase  26.67 
 
 		 418 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10961  diaminopimelate decarboxylase  25.27 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.297348  normal  0.231621 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1914  diaminopimelate decarboxylase  24.59 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  26.96 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0390  diaminopimelate decarboxylase  23.85 
 
 		 436 aa  107  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1791  diaminopimelate decarboxylase  28.86 
 
 		 423 aa  107  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  28.42 
 
 		 415 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1043  diaminopimelate decarboxylase  24.75 
 
 		 382 aa  106  9e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.504589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  28.42 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  29.09 
 
 		 425 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11971  diaminopimelate decarboxylase  22.75 
 
 		 457 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  26.7 
 
 		 423 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1724  diaminopimelate decarboxylase  25.46 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  26.59 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2086  diaminopimelate decarboxylase  25.49 
 
 		 447 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000557843  normal  0.888186 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  27.82 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2675  diaminopimelate decarboxylase  28.39 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0351  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103305 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  26.59 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  24.88 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  27.21 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  26.22 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  27.46 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1411  diaminopimelate decarboxylase  25.12 
 
 		 386 aa  105  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0507581  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1499  diaminopimelate decarboxylase  25.62 
 
 		 416 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000178536  normal  0.848919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  25.94 
 
 		 414 aa  104  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>