More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2002 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2002  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 		 415 aa  856    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3725  diaminopimelate decarboxylase  59.22 
 
 		 412 aa  528  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.176436 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0837  diaminopimelate decarboxylase  59.71 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3483  diaminopimelate decarboxylase  59.71 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4246  diaminopimelate decarboxylase  59.47 
 
 		 412 aa  525  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4883  diaminopimelate decarboxylase  59.71 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5403  diaminopimelate decarboxylase  59.71 
 
 		 412 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4771  diaminopimelate decarboxylase  58.75 
 
 		 417 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7089  diaminopimelate decarboxylase  59.61 
 
 		 413 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3229  diaminopimelate decarboxylase  58.21 
 
 		 420 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000136805 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3163  diaminopimelate decarboxylase  57.97 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3345  diaminopimelate decarboxylase  57.97 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0295344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3244  diaminopimelate decarboxylase  57.97 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000310406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3836  diaminopimelate decarboxylase  57.28 
 
 		 420 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3181  diaminopimelate decarboxylase  57.73 
 
 		 420 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02686  diaminopimelate decarboxylase, PLP-binding  58.02 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0852  diaminopimelate decarboxylase  58.02 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4107  diaminopimelate decarboxylase  57.53 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.475873  hitchhiker  0.000027959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3158  diaminopimelate decarboxylase  57.78 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.856232  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2985  diaminopimelate decarboxylase  58.02 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2986  diaminopimelate decarboxylase  57.78 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0454398 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0877  diaminopimelate decarboxylase  58.02 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02647  hypothetical protein  58.02 
 
 		 420 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3284  diaminopimelate decarboxylase  56.8 
 
 		 420 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0753  diaminopimelate decarboxylase  57.28 
 
 		 420 aa  482  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0244926  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0973  diaminopimelate decarboxylase  56.52 
 
 		 420 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3024  diaminopimelate decarboxylase  57.78 
 
 		 420 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1024  diaminopimelate decarboxylase  56.52 
 
 		 420 aa  480  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3248  diaminopimelate decarboxylase  56.52 
 
 		 420 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3486  diaminopimelate decarboxylase  57.11 
 
 		 420 aa  476  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3625  diaminopimelate decarboxylase  57.11 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0733  diaminopimelate decarboxylase  55.93 
 
 		 420 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4766  diaminopimelate decarboxylase  54.44 
 
 		 414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5726  diaminopimelate decarboxylase  54.81 
 
 		 416 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0209  diaminopimelate decarboxylase  52.29 
 
 		 412 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0158356  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1818  diaminopimelate decarboxylase  54.77 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0661432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1645  diaminopimelate decarboxylase  53.57 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2077  diaminopimelate decarboxylase  53.33 
 
 		 410 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0728152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3663  diaminopimelate decarboxylase  53.33 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.555835  normal  0.514134 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1588  diaminopimelate decarboxylase  52.84 
 
 		 410 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.220702 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0670  diaminopimelate decarboxylase  34.63 
 
 		 453 aa  236  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00590114 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2664  diaminopimelate decarboxylase  31.35 
 
 		 434 aa  228  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.287942  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0681  diaminopimelate decarboxylase  33.41 
 
 		 421 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.238588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  35.05 
 
 		 409 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28310  Diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 471 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0114023  hitchhiker  0.00277036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2159  diaminopimelate decarboxylase  34.71 
 
 		 407 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08531  diaminopimelate decarboxylase  33.74 
 
 		 406 aa  216  4e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1595  diaminopimelate decarboxylase  31.47 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2136  diaminopimelate decarboxylase  32.6 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.509779  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  33.66 
 
 		 420 aa  208  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2534  diaminopimelate decarboxylase  31.03 
 
 		 416 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1775  diaminopimelate decarboxylase  34.6 
 
 		 447 aa  206  6e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  32.3 
 
 		 399 aa  206  7e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0227  diaminopimelate decarboxylase  32.44 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690316  normal  0.715181 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  32.05 
 
 		 410 aa  204  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  35.46 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1010  diaminopimelate decarboxylase  31.75 
 
 		 421 aa  203  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.905477 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  34.99 
 
 		 417 aa  202  7e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  34.91 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  33.87 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3213  diaminopimelate decarboxylase  33.41 
 
 		 432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1409  diaminopimelate decarboxylase  31.31 
 
 		 406 aa  199  7e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  33.41 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2740  diaminopimelate decarboxylase  30.12 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  32.7 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3495  diaminopimelate decarboxylase  34.44 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.844313 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1995  diaminopimelate decarboxylase  32.3 
 
 		 439 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000281435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  33.64 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  33.57 
 
 		 417 aa  196  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 421 aa  196  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  33.96 
 
 		 418 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0791  diaminopimelate decarboxylase  30.16 
 
 		 466 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  32.62 
 
 		 416 aa  195  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  33.72 
 
 		 423 aa  194  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0038  diaminopimelate decarboxylase  34.52 
 
 		 429 aa  194  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  32.39 
 
 		 412 aa  193  4e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  33.81 
 
 		 416 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  35.29 
 
 		 419 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  35.29 
 
 		 419 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  34.59 
 
 		 445 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  33.02 
 
 		 431 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2020  diaminopimelate decarboxylase  32.31 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0997  diaminopimelate decarboxylase  33.02 
 
 		 421 aa  190  4e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.877632  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  32.08 
 
 		 407 aa  190  4e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3166  diaminopimelate decarboxylase  30.99 
 
 		 413 aa  189  8e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.603838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0396  diaminopimelate decarboxylase  33.33 
 
 		 425 aa  189  9e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0943424  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  31.55 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0481  diaminopimelate decarboxylase  33.65 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  31.81 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  34.13 
 
 		 420 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0744  diaminopimelate decarboxylase  33.81 
 
 		 438 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  34.51 
 
 		 415 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4873  diaminopimelate decarboxylase  32.79 
 
 		 421 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21592  diaminopimelate decarboxylase  32.21 
 
 		 481 aa  187  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1147  diaminopimelate decarboxylase  33.96 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5223  diaminopimelate decarboxylase  32.47 
 
 		 421 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2472  diaminopimelate decarboxylase  32.46 
 
 		 412 aa  186  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.255967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  32.86 
 
 		 418 aa  186  9e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  34.04 
 
 		 415 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>