More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3534 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3534  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
473 aa  986    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0198  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.16 
 
 
449 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  41.16 
 
 
449 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.242613  normal  0.0404177 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3484  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.45 
 
 
469 aa  330  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3546  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.58 
 
 
476 aa  326  5e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1988  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.87 
 
 
470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2271  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.88 
 
 
443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  0.774548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 
447 aa  196  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.65534 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4719  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.64 
 
 
447 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 
447 aa  183  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.102143  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.57 
 
 
441 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6872  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.32 
 
 
452 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.558153  normal  0.419879 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3539  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.74 
 
 
448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0324  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.32 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3505  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.66 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2328  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.75 
 
 
456 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459675  normal  0.238108 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2261  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.86 
 
 
451 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.501728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2260  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.01 
 
 
448 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4319  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.15 
 
 
469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3715  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.61 
 
 
455 aa  140  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3702  Rieske (2Fe-2S) region  26.38 
 
 
455 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3775  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.38 
 
 
455 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37282 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3536  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.93 
 
 
444 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3695  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.8 
 
 
460 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.036835  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3791  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.07 
 
 
362 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.71996  normal  0.360216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0979  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.83 
 
 
362 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1788  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.88 
 
 
470 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0538  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.69 
 
 
432 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0332131  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4787  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
471 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.819616  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4406  Rieske (2Fe-2S) region  25 
 
 
471 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4493  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25 
 
 
471 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.940392  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.52 
 
 
409 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0966  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.04 
 
 
397 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0374518  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.64 
 
 
457 aa  123  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6764  putative dioxygenase  35.92 
 
 
414 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.963222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0640  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33 
 
 
463 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.409215  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0558  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33 
 
 
463 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.559432  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1666  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33 
 
 
463 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33 
 
 
463 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.548645  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5639  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33 
 
 
463 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.726822  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1690  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33 
 
 
463 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5458  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5855  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33 
 
 
447 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0274508  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0525  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  32.51 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110269  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3962  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.69 
 
 
423 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.835969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2253  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.51 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.664872  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4071  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.42 
 
 
429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.177236  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6197  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  34.69 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71410  putative ring hydroxylating dioxygenase, alpha-subunit  34.69 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.306543  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4003  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.45 
 
 
383 aa  114  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3901  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  33.66 
 
 
459 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.682799  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7702  putative dioxygenase  28.94 
 
 
380 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2893  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.49 
 
 
403 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.045966  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0407  putative Rieske-type ring dioxygenase  31.02 
 
 
387 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523707  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18770  ring-hydroxylating dioxygenase, large terminal subunit  31.16 
 
 
380 aa  113  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760818  normal  0.333095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4290  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.48 
 
 
423 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0401  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  35.57 
 
 
410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0142061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4776  Rieske [2Fe-2S] region  34.18 
 
 
432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42190  aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.82 
 
 
448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0579776  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3935  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.12 
 
 
385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0946647  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3465  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.12 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0685  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.02 
 
 
484 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5070  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.97 
 
 
437 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192805  hitchhiker  0.00646968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0315  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.16 
 
 
430 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.276992  decreased coverage  0.0000264373 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4815  Rieske (2Fe-2S) region  35.08 
 
 
413 aa  110  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0953607  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5015  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.66 
 
 
413 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277088  normal  0.658452 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4490  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.66 
 
 
413 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.400487  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0890  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  31.73 
 
 
497 aa  110  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145074  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0578  Rieske (2Fe-2S) protein  30 
 
 
413 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2685  Aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase subunit alpha  30.97 
 
 
444 aa  110  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.69 
 
 
483 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.577316  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02037  putative dioxygenase (alpha subunit) oxidoreductase protein  27.97 
 
 
414 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.265627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4184  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.01 
 
 
423 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3553  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.66 
 
 
413 aa  109  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4892  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
430 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00139713  normal  0.55904 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0338  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 
430 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000696422  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3290  Rieske (2Fe-2S) region  30.34 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1622  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.2 
 
 
484 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0299575  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3710  Rieske (2Fe-2S) region  28.53 
 
 
425 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2156  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.12 
 
 
427 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5078  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.34 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27977  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1595  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.2 
 
 
483 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1647  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.2 
 
 
484 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3783  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.53 
 
 
425 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0573009  normal  0.423928 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0463  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  30.2 
 
 
484 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.328369  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5207  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.66 
 
 
413 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.114331  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.16 
 
 
430 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2194  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.58 
 
 
373 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143682  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7447  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.34 
 
 
398 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.857744 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5216  Rieske (2Fe-2S) region  31.96 
 
 
430 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168663  normal  0.0108823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0336  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.14 
 
 
430 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0008982  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2666  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 
424 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0911716  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3723  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.94 
 
 
425 aa  107  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4363  ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit  29.7 
 
 
487 aa  107  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000470921  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1952  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.81 
 
 
376 aa  107  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.27 
 
 
440 aa  107  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000409814  normal  0.0305498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4290  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.18 
 
 
435 aa  106  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2105  putative (poly)aromatic ring hydroxylating dioxygenase, alpha subunit (Rieske (2Fe-2S) region)  26.11 
 
 
427 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0327  benzoate 1,2-dioxygenase, alpha subunit  26.55 
 
 
427 aa  105  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1890  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.63 
 
 
374 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>